于运亮,李婷,王莉莉,丛培英,封建凯
1 滨州医学院烟台附属医院检验科,山东烟台 264000;2 烟台山医院病理科
泛素—蛋白酶体途径是细胞内蛋白质选择性降解的重要途径,其中泛素结合酶E2在泛素化系统中具有重要作用,是蛋白质泛素化过程中必不可少的组成部分[1]。 泛素结合酶E2C(UBE2C)和E2T(UBE2T)是泛素结合酶E2家族的成员,对调控细胞有丝分裂、细胞周期、机体免疫反应等起重要作用[2-4]。研究指出,UBE2C 和UBE2T 与直肠癌[5]、肺癌[6]、前列腺癌[7]、胃癌[8]、肝癌[9]等多种肿瘤的发生发展密切相关。目前,关于UBE2C和UBE2T是否参与胰腺癌进展的研究较少。本研究利用Oncomine、TIMER、Kaplan-Meier plotter 等多种数据库综合分析UBE2C 和UBE2T 在胰腺癌中的表达水平及其与患者预后的关系,探讨两者在胰腺癌中的调控机制,并初步分析两基因在肿瘤微环境中的表达模式及与免疫细胞浸润的相关关系,为阐明UBE2C和UBE2T基因在胰腺癌发生发展中的作用奠定基础。
1.1 胰腺癌中UBE2C 和UBE2T 表达检测 从Oncomine 数据库中筛选目的基因,检索条件设置如下。 ①“Gene:UBE2C/UBE2T”;②“Analysis type:cancer vs. normal analysis”;③“Cancer type:Pancreat⁃ic cancer”;④“Date type:mRNA”;⑤临界筛选条件(P<0. 000 1,fold change>2. 0,gene rank=top 10%)。利用GEPIA2. 0 数据库“Expression DIY”模块分析胰腺癌不同亚型中两者的表达模式。使用EMBL-EBI数据库中的“Gene expression”模块检测UBE2C 和UBE2T的mRNA在25种胰腺癌细胞系中的表达情况。
1.2 UBE2C 和UBE2T 表达与胰腺癌患者预后分析 利用GEPIA 的“Survival”模块检测UBE2C和UBE2T 基因的表达与胰腺癌患者总生存期和无病生存期的关系。采用Kaplan-Meier plotter 中“pan-cancer”模块在线分析不同临床病理特征的胰腺导管癌患者UBE2C 和UBE2T 的表达与其总生存期的关系。
1.3 胰腺癌UBE2C和UBE2T共表达基因的富集分析 利用Oncomine 数据库筛选胰腺癌……