基于生物信息学分析KNG1 在胃癌中的表达变化及临床意义

2021-10-20 06:44:44马腾达屈才浩王瑞李晓梅李玉民
山东医药 2021年28期
关键词:胃癌分析模型

马腾达,屈才浩,王瑞,李晓梅,李玉民

1 兰州大学第二医院普外科,兰州 730030;2 甘肃省消化系肿瘤重点实验室

胃癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,在所有恶性肿瘤中发病率排第5,病死率排第3[1]。胃癌患者确诊后的5年生存率为25%~30%[2],其中转移性胃癌的5年生存率仅为5%~20%[3]。致癌基因的激活、抑癌基因的失活、生长因子的过表达等分子方面的改变在这一过程中发挥重要作用[4]。因此,探讨胃癌发生发展过程中具有潜在临床意义的异常基因,可能在胃癌的诊断及治疗中发挥一定的作用。激肽源-1(KNG1)是一种具有6个结构域的多功能蛋白,在人体内源性凝血、促炎反应的激肽系统、抗菌及纤维蛋白的溶解等方面发挥重要作用,而且是半胱氨酸蛋白酶抑制剂和血管生成的调节因子[5-7]。目前研究表明,KNG1在胶质瘤、晚期结直肠癌、卵巢癌等肿瘤中异常表达[8-10]。但是,KNG1 在胃癌中的具体作用仍不清楚。本研究通过生物信息学分析,探讨了KNG1在胃癌中的表达情况及临床意义,旨在为胃癌的诊断、治疗及预后判断提供新的思路及理论基础。

1 资料与方法

1.1 KNG1 在胃癌中的表达分析 本研究从TCGA数据库(https://portal. gdc. cancer. gov/)下载了375例胃癌组织和32例癌旁组织的mRNA-seq 数据,同时下载了miRNA-seq 数据和临床数据。R 语言对原始数据进行预处理,并提取出KNG1 的表达数据。进一步利用受试者工作特征(ROC)曲线来判断KNG1 对胃癌的诊断价值,并计算曲线下面积。运用“survminer”包计算胃癌组织KNG1 表达的最佳分类节点,以此为依据,将胃癌患者分为高、低表达,进行生存分析。……

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