一株史氏鲟源腐生葡萄球菌的分离鉴定及其基因组分析

周华书

(周宁县水产技术站，福建 宁德 355400)

腐生葡萄球菌(Staphylococcussaprophyticus)是一种革兰氏阳性、凝固酶阴性、非溶血性球菌[1-2]。腐生葡萄球菌广泛存在于自然环境中，目前已报道该菌株可从女性生殖道、奶牛、腌肉制品、人胃肠道等中被分离鉴定。近年来，腐生葡萄球菌已成为动物源感染的常见病原菌[3-4]，随着抗生素的大量使用甚至滥用，导致腐生葡萄球菌具有多重耐药的趋势[5]。但关于从鲟鱼病料中分离到腐生葡萄球菌的研究却鲜有报道。另外，腐败葡萄球菌作为水产品的特定腐败菌[6]，能够迅速繁殖并产生具有腐败臭味代谢产物的菌群[7]，极大地影响了水产品的品质、贮藏货架期。细菌全基因组测序及生物信息学的快速发展，为研究腐生葡萄球菌的进化关系提供了分子水平的依据，并在葡萄球菌耐药性及致病因子、相关疫情暴发的检测和鉴定等方面均具有重要意义[8]。

2021年3月周宁县某史氏鲟养殖场的史氏鲟(Acipenserschrenckii)出现腐皮、溃疡等症状，而且有死亡病例。本研究从史氏鲟溃疡病灶处分离到1株革兰氏阳性菌，通过形态学特征、生理生化特征、16S rRNA基因序列及系统进化树对该菌株进行鉴定，研究了其耐药特性，旨在为该菌的后续研究提供指导，为该菌可能引起的疾病防治提供科学资料。同时采用高通量测序平台从全基因组序列层面分析菌株JY08的进化地位、毒力因子和耐药基因，为进一步评估该菌株基因组特征提供科学数据。

1 材料与方法

1.1 病料样品来源和主要试剂

发病的史氏鲟来源于福建省周宁县某史氏鲟养殖场，体质量为550～700 g，体长为55 cm左右。……