急性心肌梗死后心力衰竭的特异性靶点基因研究

李树杰，宋昱

（1.天津医科大学研究生院，天津300070；2.天津泰达国际心血管病医院ICU，天津300457）

急性心肌梗死是我国50～75岁人群中多发疾病， 而且死亡率居高不下[1]。急性心肌梗死主要是由持续性缺血缺氧、冠状动脉急性缺血缺氧所导致的心肌梗死。目前临床主要采取保守治疗和经皮冠状动脉介入治疗（percutaneouscoronary intervention，PCI）[2]。心力衰竭是急性心肌梗死后常见的并发症，并且与多种严重的不良预后密切相关[3-4]。然而，目前针对急性心肌梗死后心力衰竭的发病机制尚不明了。其特异性预测生物标志物和候选治疗靶点尚未完全建立。针对于此，本研究利用GEO数据库进行急性心肌梗死后心力衰竭靶点基因的筛选，并开展临床初步验证。

1 资料与方法

1.1 生物信息方法筛选差异基因

1.1.1 数据源 本研究分析数据来源于GEO数据库（http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/），编号GSE59867。芯片中包含65个样本，记录了17例急性心肌梗死患者在发病后6个月随访期间内心力衰竭发展的详细情况。本研究生物信息部分针对芯片中17例急性心肌梗死患者入院、出院（4～6 d）、1个月和6个月后外周血单个核细胞的转录谱进行分析。芯片中急性心肌梗死发生后心力衰竭患者（n=9）与非心力衰竭患者（n=8）在临床基本特征上无显著差异（P>0.05）。芯片数据是利用GPL6244平台进行分析。

1.1.2 差异基因分析 本研究以R语言中limma软件包来分析不同组之间差异表达的mRNA和miRNA，以对数转换的差异表达倍数（Log2FC）的绝对值>1和P<0.05为标准[5]。

1.1.3 miRNA靶点基因的预测 miRNA的靶点基因通过miRNA数据库（miRDB，版本6.0）进行预测[6]。Cytoscape软件（3.7.2版）用于miRNA-mRNA相关性可视化调控网络建立。