基于生物信息学的结直肠癌枢纽基因与预后相关基因筛选

2021-11-30 12:58:02李飞秦强强谷战峰张天祥申思周丽张乐莎
中华结直肠疾病电子杂志 2021年5期
关键词:数据库差异分析

李飞 秦强强 谷战峰 张天祥 申思 周丽 张乐莎

结直肠癌是一种常见消化道恶性肿瘤,2020年全球癌症统计数据[1]显示结直肠癌新增病例250万,新增死亡90万,其发病率和死亡率居于肿瘤第三位和第二位[1]。近30年来,得益于以全结肠系膜切除术(CME)和靶向治疗等为代表的一大批新型治疗方法的出现,结直肠癌患者5年生存率已有较明显提高。但目前中国结直肠癌发病率和死亡率仍呈上升趋势并有年轻化倾向[2]。现有文献[3]表明包括遗传、环境和营养在内的多种因素参与结直肠癌的发生与发展,但其具体分子机制仍不清楚。结直肠癌现有的常用检测方法有结肠镜、电子计算机断层扫描(CT)、大肠潜血试验(FOBT)、粪便免疫学测试(FIT)等。其中最具代表性的结肠镜检查虽具较高特异度和灵敏度,但它为侵入性检查且价格高,检测前准备也较为苛刻,故患者接受性差。同时结直肠癌常以出血为临床表现,因症状无特异性,70%结直肠癌出血患者第一次就诊时被误诊为痔出血、息肉出血等。另外,现有以癌胚抗原(CEA)为代表的一类生物标志物特异度和敏感度并不理想[4],部分患者初次诊断即为中晚期,这是导致患者预后不良的一个重要因素。目前临床上对结直肠癌进行治疗和预后评价主要依据肿瘤TNM分期,该分期系统仅仅包含了肿瘤范围、区域淋巴结、远处转移三个宏观预测因素且未考虑患者个体特异性[5]。对于具体基因和信号通路研究还不充分,故利用生物信息学筛选高灵敏度和特异度生物标志物用于筛查、诊疗和预后预测就显得非常有必要。……

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