ECHS1基因在肝癌细胞迁移、侵袭及预后中的作用

2021-11-30 03:30:20姚跃英林园园
胃肠病学和肝病学杂志 2021年11期
关键词:肝癌数据库差异

杨 倩,姚跃英,林园园

厦门医学院临床医学系,福建 厦门 361023

原发性肝癌是消化系统最常见恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率居高不下。现研究发现,肝癌的形成是多因素、多基因及多阶段的复杂过程,主要认为与癌基因激活、抑癌基因失活及各种生长因子表达失衡有关[1]。本研究采用8 064条人类靶基因的cDNA表达谱芯片对原发性肝细胞肝癌(primary liver cellular carcinoma,PLC)差异基因进行筛选和分析,发现烯脂酰辅酶A水合酶短链1(Enoyl coenzyme A hydratase short chain 1,ECHS1)基因在PLC中显著高表达。为进一步探讨该基因在PLC细胞迁移、侵袭中的作用,本研究依次干扰和过表达ECHS1基因观察对PLC恶性表型的影响,最后通过TCGA数据库分析ECHS1基因在肝癌组织中的表达及其对预后的影响。

1 材料与方法

1.1 材料来源选取12例厦门医学院附属第二医院2019年2月至2020年5月经手术切除、术后病理证实为PLC患者的标本12例,男8例,女4例;年龄41.3~64.8岁;术后病理证实为PLC。所有患者术前均未行放化疗、生物治疗等,切除术后新鲜标本予生理盐水冲洗,标记后置于液氮中储存。肝癌细胞株HepG2购自中科院细胞资源中心并采用STR技术鉴定细胞。将HepG2细胞置于含有10%FBS的RPMI-1640培养基中培养,在37 ℃、体积分数为5%的CO2恒温细胞培养箱中培养。该研究征得患者及其家属书面同意,并通过伦理委员会批准(批号:LL2019002)。

1.2 芯片杂交按Trizol法[2-3]提取肝癌及癌旁两组样本RNA,将两组RNA等量混合,予逆转录荧光标记,癌旁正常肝组织cDNA用Cy5-dUTP标记,而PLC组织cDNA用Cy3-dUTP标记。已标记过样品与含有8 064条人类靶基因芯片(购自深圳微芯生物公司)杂交,用……

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