原发性骨髓纤维化向AML转化过程中造血干细胞差异表达基因的生物学功能分析及核心基因筛选

王艳，张宇卉，胡耐博，滕广帅，周圆，白洁

1天津医科大学第二医院血液内科，天津300211；2中国医学科院血液病医院

（中国医学科学院血液学研究所）血液内科

原发性骨髓纤维化（PMF）是骨髓增殖性肿瘤（MPN）的一种常见类型，其发病机制与造血干细胞（HSC）的克隆性增殖关系密切［1］，主要表现为脾大、全血细胞进行性减少、骨髓纤维化等。研究［2］显示，大约20%的PMF患者在确诊后的10年内会转化为急性髓系白血病（AML），预后极差。然而，PMF的发病机制错综复杂，其向AML转化的分子机制目前尚不完全清楚，明确PMF不良预后的分子机制可以为PMF的治疗提供新的理论依据。随着基因芯片技术的发展，基因测序已成为探索疾病分子机制的重要工具［3］。单细胞RNA测序可以检测每个细胞的RNA表达谱，与传统的基因芯片技术相比具有更高的分辨率［4］。单细胞测序技术可以检测到那些传统基因芯片技术难以检测到的稀有细胞基因，而这些基因可能具有及其重要生物学意义。本研究通过对GEO数据库中单细胞测序数据集GSE153319中的HSC进行生物信息学分析，筛选出PMF向AML转化过程中HSC的差异表达基因及核心基因，为探索PMF预后不良的分子机制及PMF的治疗提供新思路。

1 资料与方法

1.1 数据集的选取以“Primary myelofibrosis and Acute myeloid leukemia”为检索关键词，从GEO数据库中检索符合条件的单细胞测序数据集，最终选取基因芯片GSE153319为研究对象。GSE153319数据集包含1例PMF患者进展为AML过程中三个不同时间点（PMF慢性期、芦可替尼治疗后8个月、AML转化期）的样本。

1.2 HSC细胞和高变基因的筛选……