陈丽君,阚红星,丁 然,侯 俊,杨银凤
(安徽中医药大学医药信息工程学院,安徽 合肥 230012)
咳嗽变异性哮喘(cough variant asthma,CVA)通常表现为气道反应过度,嗜酸性炎症和咳嗽。CVA是哮喘的前兆。据统计,有50%~80%的儿童和10%~33%的CVA成人会发展为典型的哮喘。CVA的发病机制及病理生理表现与典型哮喘相似,均为多种炎症细胞和炎症递质参与的慢性呼吸道炎症性疾病。目前治疗CVA的药物有激素和支气管扩张剂,但此类药物长期使用存在毒性和不良反应,而且停药后易复发。
止嗽散收载于清代程钟龄《医学心悟》中,对CVA具有显著的疗效。该方由桔梗、甘草、白前、紫菀、荆芥、陈皮、百部组成。方中紫菀、百部味苦,止咳化痰,共为君药;桔梗开宣肺气,白前降气化痰,共为臣药;荆芥疏风解表,陈皮理气化痰,共为佐药;甘草调和诸药,配桔梗又有利咽止咳之功,共为佐使药。
本研究旨在通过整合药物代谢动力学数据,进行多重药物靶点预测和分子对接分析,以探究止嗽散治疗CVA的作用机制。
1.1 活性成分的筛选 通过中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)、中国中药整合数据库(traditional Chinese medicine integrated database,TCMIP)和文献检索收集止嗽散中7味中药的分子数据集。同时,将口服生物利用度(oral bioavailability,OB)、类药性(drug likeness,DL)、药物半衰期(half life,HL)的阈值分别设置为OB≥30%,DL≥0.2,HL≥4,以同时满足这3个条件的化合物作为止嗽散方中潜在的活性成分。
1.2 靶点的预测 运用TargetNet、Swiss Target Prediction和基于支持向量机(support vector medicine,SVM)、随机森林法(random forest, RF)的SysDT(Systems drug targeting,SysDT)模型预测靶点。在SysDT方法中,将同时满足RF≥0.7和SVM≥0.8的化合物-靶点相互作用视为有效靶点。此外,将化合物……