黄霏霏 张朝然
随着人类基因组计划的完成,蛋白质组学已悄然成为后基因时代的研究热点。与基因组相比,生物体的复杂性及多样性更多的是由蛋白质决定,而传统的对单个蛋白质进行研究的方法已无法满足后基因组时代的要求,因此大规模、全方位的蛋白质研究势在必行,蛋白质组学也由此诞生。本文主要对基本概念、研究方法及其在眼表疾病的应用等方面的新进展进行综述。
蛋白质组是一个基因组或一个细胞、组织表达的所有蛋白质,不仅包括基因转录产物直接翻译的蛋白质,还包括转录产物选择剪接后所编码的蛋白质以及翻译后修饰的蛋白质等。基因组对于生物体来说是相对恒定的[1],是对生物功能的静态分析。而从基因到蛋白质还存在翻译调节以及翻译后的加工修饰等多个步骤,mRNA的水平与蛋白质的表达并不存在直接关系[2]。因此,要更好地了解机体各项机制,就必须对机体功能的直接执行者蛋白质进行深入的研究。1994年蛋白质组学(proteomics)的概念被首次提出,它是指从整体出发,研究动态变化的生物体所有蛋白质组成、表达和修饰状态等,分析蛋白质之间及其与药物之间的相互作用,更深刻地探索不同生理、病理状态下的生命活动规律[3]。
蛋白质组学基本技术流程包括从生物样品中提取蛋白质,将蛋白混合物分离、染色,得到蛋白质表达谱;运用计算机图像处理技术对蛋白质进行定位、定量及差异点寻找;最后鉴定蛋白质种类及肽序列。……