迎接高通量测序技术诊断儿童遗传性疾病的新时代



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迎接高通量测序技术诊断儿童遗传性疾病的新时代

夏 凡 教授周文浩 教授王慧君 副研究员

周文浩教授 非常荣幸能邀请到美国贝勒医学院夏凡教授来复旦大学附属儿科医院讲学，并就分子遗传诊断中心的工作给予非常具体的指导。复旦大学附属儿科医院分子诊断实验室已经开展100余项基因检测项目，应用Sanger测序、aCGH和MLPA等技术，建立了常见单基因遗传病的筛查和诊断平台，二代测序检测项目也初步展开。全外显子组测序(WES)技术，为寻找疾病的致病基因、易感基因等研究，提供了一种全新的研究方法。Science将WES评为“2010年世界十大科技进展”之一。

夏 凡教授 外显子组(exome)即一个个体的基因组DNA上所有蛋白质编码序列(外显子)的总和。人类外显子组序列仅占人类整个基因组序列的1%，约为30 Mb，包括约18万个外显子，估计85%的人类致病突变都位于这1%的蛋白质编码序列上。

从近5年采用WES用于临床诊断的文献可以看出其应用的趋势。2009年，HowardHughesMedicalInstitute报道了第1篇WES用于临床诊断的文章；2010年，NatureGenetics发表了3个不同的家系应用WES进行临床检测的文章。2013年美国贝勒医学院对250例先证者行WES临床检测，阳性率在25%，发表在NewEnglandJournalofMedicine。2014年，我们将病例进一步扩大到了2 000例，发表在JAMA上。估计在2015年三、四季度会出现全基因组序列分析(WGS)在临床广泛推广的报道。

从已发表的文献来看，采用WES进行临床诊断的病例主要集中在儿科，比如发表在JAMA上的2 000例先证者，88%为儿科患者，平均年龄仅6岁。

周文浩教授 WES主要适用于儿科什么样的疾病？……