高通量测序数据分析和临床诊断流程的解读

黎籽秀 刘 博 徐凌丽 杨 琳 王慧君 周文浩



·讲座·

高通量测序数据分析和临床诊断流程的解读

黎籽秀1刘 博2徐凌丽3杨 琳3王慧君4周文浩4

高通量测序技术也称二代测序技术，可以一次对几十至几百万条短序列片段同时进行测定。该技术的出现使研究者可以对一个物种的基因组、转录组和表观遗传组进行全面的分析。基因组二代测序可用于对全基因组、全外显子组或感兴趣的特定区域进行序列测定。通常，基因组二代测序的目的是检测个体基因组范围内的遗传变异，包括单碱基变异(SNVs)、插入缺失变异(Indels)、拷贝数变异(CNVs)和结构变异(SVs)，并最终筛选出致病突变[1]。

近年来，基因组二代测序开始逐步应用于临床分子诊断[2～8]，不仅能帮助医生明确患者的遗传学病因，指导治疗及判断预后，更重要的是可为遗传咨询提供明确的指导。根据患儿及其父母的遗传信息，可判断患儿致病成因是新生突变还是遗传于父母，以此评估父母生育下一胎时的疾病遗传风险，对家庭的“优生”提供更好的指导。

基因组二代测序技术与传统分子检测技术不同，可以同时对大量基因进行检测，一次性获得海量的数据。因此，构建一个基于遗传性疾病诊断需要的基因组二代测序数据分析流程，以期从众多变异中筛选出潜在致病突变，显得尤为重要。复旦大学附属儿科医院转化医学中心团队在美国贝勒医学院人类与分子遗传系的学习、交流和指导下，通过参……