甜瓜蔗糖转化酶基因的密码子偏好性分析

赵　莉，李思怡，张立虎，李　冠

(新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐 830046)



甜瓜蔗糖转化酶基因的密码子偏好性分析

赵莉，李思怡，张立虎，李冠*

(新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐 830046)

摘要：以甜瓜蔗糖转化酶基因序列为材料，研究甜瓜蔗糖转化酶基因密码子偏好性，为改良甜瓜风味与品质提供理论依据。运用在线分析软件CodonW对甜瓜蔗糖转化酶的编码序列(Coding sequence，CDS)进行密码子分析，利用Mobyle在线工具分析同义密码子相对使用度(RSCU)、有效密码子数(ENC)、GC及GC1s、GC2s、GC3s含量。甜瓜蔗糖转化酶基因偏好于以A或T结尾的密码子。密码子ATT、GTT和AGA的RSCU值都大于1，属于共同偏好使用的密码子，而密码子GCG、CGG的RSCU值小于1，属于使用频率较低的密码子。发现密码子偏好性与亲缘关系的远近有一定的关系。要实现目的基因在外源表达系统中的成功表达和提高其表达量，可通过增加目的基因剂量，目的基因密码子优化，改善培养条件等方法实现，其中目的基因密码子优化起到了关键作用。

关键词：甜瓜；蔗糖转化酶；密码子偏好性

甜瓜(CucumismeloL.)果实中主要含有还原糖(葡萄糖、果糖)和非还原糖(蔗糖)，以及柠檬酸和苹果酸等成分,不同的糖酸组分及含量形成了不同风味，其中糖酸代谢酶起到了重要作用[1]。甜瓜果实中积累的糖分主要是蔗糖，而蔗糖的积累又一定受某种特定的代谢机制的调控,而蔗糖转化酶就是果实中蔗糖代谢相关酶中重要的一种，普遍的存在于酵母、细菌和植物中，在植物糖代谢中发挥着重要的作用，能够不可逆的催化蔗糖水解成葡萄糖和果糖。……