鸡Sepp1基因及其蛋白理化性质和分子结构的生物信息学分析

2016-07-21 08:50:48王顺利庞瑞华李永能李琦华潘洪彬杨明华赵素梅
生物信息学 2016年2期
关键词:分子结构

王顺利,庞瑞华,黄 英,李永能,李琦华,潘洪彬,杨明华*,赵素梅*

(1.云南农业大学云南省动物营养与饲料重点实验室,昆明 650201;(2.河南信阳师范学院生命科学学院,河南 信阳 464000;(3.云南农业大学招生就业处,昆明 650201)



鸡Sepp1基因及其蛋白理化性质和分子结构的生物信息学分析

王顺利1,庞瑞华2,黄英1,李永能3,李琦华1,潘洪彬1,杨明华1*,赵素梅1*

(1.云南农业大学云南省动物营养与饲料重点实验室,昆明 650201;(2.河南信阳师范学院生命科学学院,河南 信阳 464000;(3.云南农业大学招生就业处,昆明 650201)

摘要:硒是人和动物生命必需的微量元素,硒的生物学功能是通过硒蛋白来实现的,硒蛋白P(Selenoprotein P,Sepp1)是机体含量最多的硒蛋白。利用生物信息学相关分析软件和比较基因组学的方法,对鸡Sepp1基因序列和氨基酸序列进行理化性质和结构特征进行分析和预测,并与猪、人、鼠、羊、狗等物种进行比较。结果显示,鸡Sepp1的CDS序列和编码的蛋白质与禽类动物相似,但和哺乳类动物之间差别较大;Sepp1的功能特性与硒半胱氨酸含量有关,不同物种Sepp1中硒半胱氨酸含量存在着差异;鸡Sepp1蛋白在第170-200位氨基酸残基区域具有特定理化性质和分子结构,推测该序列可作为调控鸡Sepp1功能的靶位点。研究结果为以后深入研究鸡Sepp1的机体功能、开发富集Se的动物功能性食品提供理论参考。

关键词:Sepp1;鸡;生物信息学;理化性质;分子结构

硒是人和动物生命必需的微量元素,参与谷胱甘肽(GSHPx)的合成,具有抗氧化损伤的作用。硒的生物学功能是通过硒蛋白来实现的。……

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