凌英会,朱 龙,睢梦华,郑 琪,吴 昊,张运海,章孝荣,3*
(1.安徽农业大学动物科技学院,合肥 230036; 2.安徽地方畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室,合肥 230036;3.安徽省羊繁育工程技术研究中心,合肥 230036)
卵泡期和黄体期山羊垂体miRNAs表达谱及差异分析
凌英会1,2,朱 龙1,2,睢梦华1,2,郑 琪1,2,吴 昊1,2,张运海1,2,章孝荣1,2,3*
(1.安徽农业大学动物科技学院,合肥 230036; 2.安徽地方畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室,合肥 230036;3.安徽省羊繁育工程技术研究中心,合肥 230036)
旨在通过高通量测序的方法筛选与分析卵泡期和黄体期安淮山羊垂体中差异表达miRNAs,探索垂体在转录后水平调节山羊从卵泡期-黄体期过渡中发挥的作用。测序结果表明,卵泡期和黄体期文库分别得到11 319 069和11 432 846条原始序列。经过去除杂质后,得到11 162 888和11 016 138条纯净序列。在两个不同时期的文库中,分别检测到148和150种差异表达的miRNA,有147种miRNA共同表达;分别预测到52和95种差异表达的miRNA,有27种miRNA两文库共同表达。已知miRNA中,let-7f在两文库表达量最高,且差异极显著;新miRNA中,novel-miR-159在两文库表达量最高,且差异极显著。通路分析表明,ko00511、ko00052、ko01100、ko00030、ko00520 5个通路可能影响性激素的合成。测序获得安淮山羊垂体组织miRNA序列及表达谱,垂体组织miRNA表达丰富,且表达量各异。研究结果有助于理解miRNA在山羊垂体中调节性激素分泌的作用,并且所鉴别的miRNA有助于后续卵泡期~黄体期转变的相关研究。
miRNA;山羊;卵泡期;黄体期;垂体;Solexa
microRNA(miRNA)是一种内源性的18~22个核苷酸的非编码RNA,可以在转录后水平通过抑制mRNA翻译或促使miRNA降解进而调节基因的表达[1]。……