唐培安 吴海晶 薛 昊 孔德英 宋 伟
印度谷螟18SrDNA的克隆及定量PCR方法的建立
唐培安1吴海晶1薛 昊1孔德英2宋 伟1
(南京财经大学食品科学与工程学院;江苏省现代粮食流通与安全协同创新中心1,南京 210023)
(重庆出入境检验检疫局2,重庆 400020)
利用分子生物学方法从印度谷螟幼虫体内克隆获得了18S rDNA的基因全长序列(1 888 bp,GenBank登录号为KJ836335)。利用邻位连接法(neighbor-joining)分别构建了基于18S rDNA基因全长、保守序列II以及多变区的系统发育树,比较了与其他已知昆虫18SrDNA基因的同源性和遗传距离。与其他序列的系统发育树相比,其全长序列的系统发育树更能反映鳞翅目昆虫的亲缘关系,印度谷螟与大蜡螟的亲缘关系最近。此外,建立了以18SrDNA为内参基因的实时荧光定量PCR方法。
印度谷螟 18SrDNA 系统发育树 实时荧光定量PCR
核糖体RNA(ribosomal RNA,rRNA)是生物体中核糖核酸(RNA)的一类,为核糖体的主要组成部分,其功能为提供tRNA与mRNA密码子对应的环境,从而完成蛋白质的合成[1]。核糖体由1个大亚基和1个小亚基构成,在真核生物核糖体的小亚基中含有1个沉降系数为18S的RNA,该RNA由染色体基因编码,称为18SrDNA 基因,长度约为1 800 bp[2]。在生物的进化过程中非常保守,是研究生物高级分类群系统演化的难得工具之一[3]。另外,18SrDNA基因在生物体内的表达水平相对稳定,可作为内参基因广泛应用于基因表达研究中,是应用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR)技术进行基因的相对定量检测时常用的内参基因之一[4-7]。
印度谷螟Plodia interpunctella (Hübener)隶属于鳞翅目(Lepidoptera)螟蛾科(Pyralidae),是一种世界性储粮害虫,我国华北及东北地区受其危害尤其严重。……