板栗过氧化氢酶基因CAT1的克隆及生物信息学分析

葛 颖,苗英杰,吴祖芳,翁佩芳,张 鑫

(宁波大学食品科学与工程系,应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波 315211)



板栗过氧化氢酶基因CAT1的克隆及生物信息学分析

葛 颖,苗英杰,吴祖芳*,翁佩芳,张 鑫

(宁波大学食品科学与工程系,应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波 315211)

为研究板栗过氧化氢酶基因CAT1的功能,旨在为其采后贮藏中品质变化研究提供分子机理基础。以板栗为试材,提取总RNA,通过cDNA末端快速扩增技术(RACE),克隆到板栗CAT1基因cDNA全长,并对其进行生物信息学分析。结果表明,该基因序列全长1485 bp,包含一个1479 bp的开放阅读框,编码492个氨基酸。氨基酸序列分析表明,板栗CAT1与枣(Ziziphusjujuba)、烟草(Nicotianatabacum)、陆地棉(Gossypiumhirsutum)等植物过氧化氢酶CAT1氨基酸序列有较高的相似性。蛋白分析表明,该蛋白分子量为56947.31 Da,理论等电点6.65,属稳定性亲水蛋白;亚细胞定位于过氧化氢酶体,存在30个磷酸化位点,无信号肽。二级结构以α螺旋、无规则卷曲为主。保守结构域预测表明,该基因编码蛋白属于Catalase-like超家族。本研究克隆获得了板栗CAT1基因,为进一步研究该基因的生物学功能奠定了基础。

板栗,CAT1基因,克隆,生物信息学分析

板栗(Castaneamollissimablume)俗称“栗子”,山毛榉科栗属坚果类植物,是我国重要的经济树种,栽培历史悠久,分布广泛[1-2]。板栗果实营养丰富,富含淀粉,蛋白质,脂肪,多种维生素及矿物质等;据测定,每100 g栗实中含碳水化合物42 g、蛋白质4.8 g、脂肪1.5 g、抗坏血酸46 mg、铁15 mg[3-4]。板栗既可生食、炒食和煮食,又可制成糕点、栗酱、罐头、饮料等食品;如糖炒栗子,风味极佳,深受消费者喜爱[5]。……