杨 鹏,关 萍,陈兴银,张凯凯,彭昌琴,成 宇,石建明
(贵州大学 生命科学学院,贵州 贵阳 550025)
基于GenBank数据探讨兜兰属植物DNA条形码
杨 鹏,关 萍,陈兴银,张凯凯,彭昌琴,成 宇,石建明*
(贵州大学 生命科学学院,贵州 贵阳 550025)
为筛选出适合兜兰属植物的DNA条形码序列。本研究基于GenBank中下载的29种兜兰属植物的253条序列,利用遗传距离法及分子系统学方法分析兜兰属植物候选条形码。结果表明,在选取的3个候选序列片段中对兜兰属植物鉴定的成功率最高的是核糖体ITS(nrITS)序列,分辨率为62.96%,其次是叶绿体matK序列,分辨率为50%,最后是叶绿体rbcL序列,分辨率仅为21.43%,因此,本研究推荐nrITS序列作为兜兰属植物的DNA条形码候选序列,叶绿体matK序列作为补充序列。
兜兰;DNA条形码;nrITS序列
兜兰是兰科(Orchidaceae)兜兰属(PaphiopedilumP)植物的统称,多生长于热带及亚热带林下,是兰科植物中最具特色的一个类群,也是最具特色魅力的观赏性花卉植物[1,2]。全世界兜兰属植物有96~100个种,主要分布在印度东部至我国南部、东南亚、菲律宾及马来西亚群岛地区[3],由于具有极高的观赏价值和经济价值,导致人们对兜兰野生资源进行了毁灭性的采挖,加之生境破坏等原因,野生兜兰的数量急剧减少,分布区逐渐萎缩,使得兜兰野生种均被列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》[4]。近年来,人们为了保护兜兰种植资源,兜兰的杂交种也随之增加,加之相互引种,导致人们对兜兰属植物鉴定增加了一大难度[5]。
DNA条形码技术(DNA barcoding)是用DNA保守片段对物种进行……