四倍体海岛棉LTR反转录转座子的数量与分布

刘震 张树林 史莹慧 彭仁海

（安阳工学院生物与食品工程学院，安阳 455000）

长末端重复序列（Long terminal repeat，LTR）反转录转座子是真核生物基因组中普遍存在的一类可移动的DNA序列，它们以RNA为媒介，通过“复制-粘贴”的形式在基因组中不断自我扩增。LTR反转录转座子的插入和删除对基因组的进化和物种的环境适应能力都具有重要的意义［1］，此外，LTR反转录转座子、基因组重复和多倍化是导致植物基因组扩增和收缩的三个主要原因［2，3］。LTR反转录转座子根据内部编码基因（gag，pol和int）排列顺序的不同，分为Copia和Gypsy两类主要的超家族［4］。LTR末端不编码蛋白质，但包含转录的起始信号和终止信号，内部编码区gag基因编码的蛋白负责反转录转座子RNA的成熟和包装，pol基因编码反转录酶和 RNAse H，INT（Integrase）基因编码整合酶［4］。

LTR反转录转座子的插入除了可以导致基因组的膨胀外，更重要的是影响插入位点及其相邻基因的表达［5，6］。LTR反转录转座子能够完成自我转录是因为其本身含有转录所需的调控元件。当LTR反转录转座子插入到基因编码区就可能导致该基因转录成不完整RNA序列，进而不能被翻译成完整的肽链，或者该RNA失去其调控能力；当LTR反转录转座子插入到基因附近区域时，其序列内的调控元件将会发挥作用，并影响附近基因的表达［7］。

棉纤维是纺织工业中天然纤维的主要来源。中国种植的四倍体棉花主要包括陆地棉和海岛棉两个栽培种，陆地棉丰产性好，而海岛棉不仅纤维品质优良，而且是盐碱地的主要栽培作物。……