浅析荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸的质控结果

2018-10-24 09:25张秀华
健康大视野 2018年9期

张秀华

【摘要】目的:为进一步提高本单位在使用荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸方面的检验水平。方法:对本单位的荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸的质控考核结果进行分析。结果:在本次质控考核实验中,检出流感病毒甲1型和流感病毒甲3型,根据分子生物考核操作标准,本单位使用荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸方面的检验情况合格。结论:荧光实时定量PCR法在检测流感病毒核酸方面具有广泛的应用空间,可以为一些突发性公共性事件的检验提供准确的数据,值得进一步推广。

【关键词】荧光实时定量PCR法;流感病毒核酸;质控

【中图分类号】R466

【文献标志码】A

【文章编号】1005-0019(2018)09-110-01

荧光实时定量PCR法的临床应用,最大程度改善了传统PCR法特异性不强、污染的问题,并通过电脑软件的配合性应用[1],实现了在每一轮循环都可检测出一次荧光信号强度,进而获得标准曲线获得定量的检测结果。目前,荧光实时定量PCR法在临床疾病诊断、动物疫病检测、食品安全等领域已经发挥出重要作用。为进一步提高本单位在使用荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸方面的检验水平。本文特对本单位的荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸的质控考核结果进行分析。

1实验材料和方法

11实验材料流感病毒灭活抗原标本三份、流感病毒RNA提取液、流感病毒核酸荧光PCR法检测试剂盒(甲1型流感病毒、甲3型流感病毒、乙型流感病毒)、流感病毒核酸荧光PCR法检测1μl9混合液、1μl混合酶、5μl处理完毕样本,25μl反应体系。实时定量荧光检测仪(型号为7300)、冷冻离心机(型号为38R)。

12方法

121实验操作标准参照分子生物考核操作標准[2]、荧光实时定量PCR法操作规程流程进行实验操作。

122具体实验步骤

1221提取流感病毒核酸RNA将流感病毒裂解液500μl和流感病毒培养液100μl加入到15ml离心管中,混合充分后加入乙醇溶液(70%)600μl,取出RNA提取柱将600μl混合液加入,使用冷冻离心机进行15秒离心处理,设定离心速率为(12000rpm),弃去收集管液体[3],在进行15秒离心处理,设定离心速率为(12000rpm),再弃去收集管液体,加入清洗液RW1700μl,进行15秒离心处理,设定离心速率为(12000rpm),取一干净收集管移取RNA提取柱,在柱中加入清洗液RPE500μl,进行15秒离心处理,设定离心速率为(12000rpm),弃去收集管液体,再次加入清洗液RPE500μl,进行3分钟离心处理,设定离心速率为(13000rpm),取出提取柱,移到一支15ml干净离心管中,在柱中加入无核糖核酸酶水50μl,在20摄氏度室温下放置2分钟后,进行1分钟离心处理,设定离心速率为(12000rpm),抛弃提取柱,即得流感病毒核酸RNA,在20摄氏度下保存待用。

1222扩增流感病毒甲1型核酸荧光PCR法检测19μl混合液、1μl混合酶、5μl处理完毕样本,25μl反应体系,选择VIC荧光检测通道[4]。流感病毒甲3型核酸荧光PCR法检测19μl混合液、1μl混合酶、5μl处理完毕样本,25μl反应体系和流感病毒乙型核酸荧光PCR法检测19μl混合液、1μl混合酶、5μl处理完毕样本,25μl反应体系选择FAM荧光检测通道。扩增时,注意盖好PCR反应盖,设定PCR扩增反应的条件[5]为:10分钟45摄氏度—15分钟95摄氏度15秒、60摄氏度60秒循环,反复循环扩增50次,根据基线最后取3个到15个循环荧光信号值。

1223结果判定标准当Ct阈值大于等于40时表示结果为阴性,当Ct阈值小于40时表示结果为阳性。

2结果

在本次质控考核实验中,检出流感病毒甲1型和流感病毒甲3型,根据分子生物考核操作标准,本单位使用荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸方面的检验情况合格。

3讨论

荧光实时定量PCR法,是指在PCR的反应体系中加入特有的荧光基团,通过对荧光信号的实时积累信号检测对PCR反应过程进行有效监测,再使用相应电脑软件进行标准曲线的绘制,最终达到对制定目标的定量分析。荧光实时定量PCR法的临床应用显著提高了传统PCR法检测的缺点,经临床使用发现具有快速、稳定、安全、操作简便、重复性高的诸多优点,由于其整个实验过程都是在一个相对封闭环境中进行的,所以大大降低了污染的风险。但是在实践操作中我们也发现,荧光实时定量PCR法也存在一定显著的缺点,例如:对实验操作的要求比较高,需要操作人员数量掌握相关原理、步骤、要点,并且影响实验的因素也比较多,需要环境温度等因素相对稳定,此外实验成本比较高,在基层普及中存在一定困难。分析本次质控考核实验结果,本次试验检出流感病毒甲1型和流感病毒甲3型,根据分子生物考核操作标准,本单位使用荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸方面的检验情况合格。其中流感病毒乙型核酸未被检测出来,分析原因认为和实验试剂浓度有一定关联,但需要进一步验证。综上所述,荧光实时定量PCR法在检测流感病毒核酸方面具有广泛的应用空间,可以为一些突发性公共性事件的检验提供准确的数据,值得进一步推广。

参考文献

[1]龙春平,孔令军,吴周建,荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸的质控结果分析[J],中国卫生检验杂志,2008,18(6):1107—1108

[2]张弛宇,李全双,孙金燕,等,荧光实时定量PCR的研究进展[J],江苏大学学报,2006,16(3):268—270

[3]罗淑华,黄胜中,李宇聪,等,荧光实时PCR检测法在突发公共卫生事件的应用[J],中国卫生检验杂志,2008,18(12):2611—2754

[4]刘继峰,关翠萍,徐田红,等,单纯疱疹病毒2型ICP4基因荧光实时定量PCR检测方法的建立[J],医学研究杂志,2008,37(12):36—38

[5]陶志华,谢耀盛,陈晓东,等,不同标本对荧光实时定量PCR法测定HBV-DNA结果的影响[J],临床检验杂志,2001,19(6):345—346