基于生物信息学分析细胞周期蛋白依赖蛋白激酶5表达与胃癌免疫浸润细胞的相关性△

曹龙龙，谢建伟，李平，郑朝辉，黄昌明

福建医科大学附属协和医院胃外科，福州 350001

胃癌是一种严重的公共健康问题。据报道，全世界每年胃癌发病数量超过951 600例，现已成为第三大肿瘤相关死亡病因。胃癌的发病机制复杂，预后差，病死率高。尽管胃癌的综合治疗措施不断完善，但仍未能获得满意效果。近年来，对免疫检查点的阻断已进行了积极研究，并已为多种恶性肿瘤（如转移性黑色素瘤和非小细胞肺癌）带来了巨大的临床获益。但是，研究发现多种肿瘤类型中只有不到40%的病例对程序性死亡受体1（programmed cell death 1，PDCD1，也称PD-1）/程序性死亡受体配体1（programmed cell death 1 ligand 1，PDCD1LG1，也称PD-L1）阻断有反应，并且据报道肿瘤对免疫疗法有主要或次要抵抗力。细胞周期蛋白依赖蛋白激酶5（cyclin-dependent protein kinase 5，CDK5）属于周期蛋白依赖蛋白激酶（CDK）家族成员。既往研究显示，CDK5除了参与神经细胞的调控外，还参与了多种肿瘤的发生发展及凋亡过程。最近研究显示，CDK5的缺失可通过干扰PD-L1的表达而参与肿瘤免疫逃逸。然而，关于CDK5是否影响肿瘤免疫浸润细胞的类型和数目尚不清楚。本研究收集36例胃癌患者的胃癌石蜡组织，并通过生物信息学分析，探讨CDK5表达是否影响胃癌免疫细胞浸润，现报道如下。

1 对象与方法

1.1 研究对象

从公共数据库癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas，TCGA；https://portal.gdc.cancer.gov/）及基因表达数据库（Gene Expression Omnibus，GEO；https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/）中获取胃癌患者高通量测序数据集。TCGA数据集中纳入包含完整临床资料的358例胃癌组织（T）及22例癌旁组织（N）。GEO数据库中选取包含胃癌组织和癌旁组织或健康者胃黏膜组织……