基于网络药理学研究杨桃根防治糖尿病肾病的作用机制

张宏亮，蒋 霞，黄天敏，丘 岳，黄光明，黄仁彬，黄振光

广西医科大学第一附属医院药学部，南宁 530021

糖尿病肾病(diabetic kidney disease，DKD)是糖尿病的主要并发症之一，亦是发达国家和地区终末期肾病(end-stage renal disease，ESRD)的首要原因[1]。目前对于DKD，尚缺乏特异性的治疗药物。临床上主要通过控制血糖、血压、血脂、尿酸以及使用肾素-血管紧张素系统抑制剂、改善肾脏微循环药物等延缓DKD进展[2]。

中草药由于其多组分、多途径、多靶点的优势，在复杂疾病的防治方面显示了良好的效果。我们前期开展了若干抗DKD中草药及其活性成分的研究，发现酢浆草科属植物杨桃根(the root ofAverrhoacarambolaL.，RAC)在防治DKD方面显示了良好的优势[3]，但作用机制不明。网络药理学是基于整体性与系统性的一种研究方法，将药物-靶点与生物信息网络相结合，类似于中医提出的整体、辨证的观点[4]。基于此，我们将采用网络药理学方法，构建杨桃根主要成分与DKD共有靶点，探讨杨桃根防治DKD的潜在作用机制。

1 研究方法

1.1 杨桃根有效成分筛选

根据我们课题组前期关于杨桃根物质基础的研究结果[5,6]，结合查询关于杨桃根成分的文献，建立成分库。通过PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/search/)和Chemspider数据库(http://www.chemspider.com/Default.aspx)，查询已鉴定的成分的Canonical SMILES 字符串。

1.2 靶点筛选

杨桃根成分的靶点预测采用Swiss Target Prediction数据库( http://www.swisstargetprediction.ch/)。该数据库通过2D和3D结构相似性的特点，间接预测化合物的作用靶点[7]。具体操作为，将上一步查询到的Canonical SMILES字符串输入Swiss TargetPrediction网站，从而获得每一成分的潜在靶点。

DKD疾病靶点预测采用GeneCards数据库(https://www.genecards.org/)。分别以“Diabetic Kidney Disease”，“Diabetic nephropathy”作为关键词进行检索，以相关性分数(Relevance score≥30)作为筛选条件，从而得到DKD相关靶点。……