鸭胸肌肌内脂肪含量全基因组关联分析

刘文静，凡文磊，刘大鹏，赵金山，周正奎*，侯水生*

（1.青岛农业大学动物科技学院，山东青岛 266109；2.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 100193）

我国是鸭肉生产和消费大国，鸭存栏量和消费量约占全球的75%[1]。北京鸭肌内脂肪含量为4%～6%[2]，肉质极为鲜嫩。脂肪包含多种脂肪酸，会影响肉的风味、pH、嫩度和多汁性[3]。为探究影响肌内脂肪沉积的遗传机制，Ge 等[4]和徐思雨[5]分别利用巢湖鸭和麻鸭鉴定COMT、NT5E、PDE4D、PLA2G4F、A-FABP和CIDEa、FAS、ATGL基因与肌内脂肪相关。诸多研究报告均表明肌内脂肪沉积受基因调控[4,6]，但影响该性状的主效基因和遗传机制仍需进一步挖掘和验证。

随着高通量基因分型技术的发展，全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study，GWAS）[7]得到更广泛应用，可以更精准定位影响复杂性状的基因。Cho等[8]结合GWAS 和连锁不平衡分析鉴定出MYH3基因的一段功能性调控序列变异影响猪肌内脂肪积累；其他研究者也在牛[9-10]和鸡[11-12]等物种上鉴定出影响肌内脂肪沉积的相关基因，如FABP、MC4R、FAS、ELOVL5、FASN和CASP2等。为找到影响鸭胸肌肌内脂肪沉积的关键基因，本实验以北京鸭× 野鸭F2代资源群体为研究材料，测定胸肌肌内脂肪含量并进行GWAS 分析，鉴定影响鸭胸肌肌内脂肪的相关基因及其遗传机制，为改良鸭胸肌肉质提供有效的分子标记。

1 材料与方法

1.1 实验动物和样品采集 本研究实验材料是由中国农业科学院北京畜牧兽医研究所昌平基地种鸭保种场提供。于2015 年以北京鸭（41 只，8 ♂、33 ♀）和绿头野鸭（28 只，4 ♂、24 ♀）为F0代进行正反交构建的F2代资源群体，在相同环境和饲粮条件下饲养至8 周龄，在相同的环境条件下进行屠宰。……