基于网络药理学探讨丹红注射液治疗银屑病的作用机制

2021-08-21 09:59:34吴燕瑜齐俊南
药品评价 2021年11期
关键词:数据库

吴燕瑜,齐俊南

江西中医药大学附属医院,江西 南昌 330006

银屑病是一种以斑块、鳞屑为主要表现的慢性皮肤病,其主要发病机制为表皮的过度增厚及免疫反应[1]。本病主要分为寻常型、关节型、脓疱型、红皮型四型,而寻常型银屑病发病率占90%以上[2]。近年来,随着中成药的应用,不仅拓宽了治疗银屑病的思路,也使银屑病的治疗效果得到了提高。丹红注射液是丹参和红花的提取物[3],据中医理论,丹参和红花在活血化瘀通络方面是相须为用的,二者联合应用加强了活血化瘀的作用,因此,丹红注射液广泛应用于心脑血管等疾病[4-6]。针对其凉血活血的功效,本研究通过网络药理学探究丹红注射液治疗银屑病的作用机制。

1 方法

1.1 药物成分检索及收集

通过使用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP,http://tcmspw.com/index.php)分别检索“丹参”“红花”,设定阈值为OB(口服生物利用度)≥30%,DL(化合物类药性)≥0.18,筛选并收集两个药物的有效成分。

1.2 活性化合物标靶蛋白的筛选

使用PubChem 有机小分子生物活性数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)查找活性化合物的2D结构图,将化合物的2D 结构图导入Swisstargetprediction(http://www.swisstargetprediction.ch/)进行靶标蛋白检索,物种选择为智人(Homo sapiens)。

1.3 疾病靶点的筛选

使用Gencards(https://www.genecards.org/)、OMIM(https://omim.org/)等数据库,以“psoriasis”为关键词进行检索,检索银屑病的相关基因。

1.4 基因名称的标准化以及化合物-基因靶点的网络的构建

使用Uniprot(https://www.uniprot.org/)数据库查询靶标基因的标准化名称,将药物化合物、靶标基因导入cytoscape 3.8.0 软件中构建药物-化合物-基因靶点网络图,并分析化合物与靶点之间的度值。

1.5 交集基因的筛……
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