基于生物信息学探讨骨关节炎患者LncRNA表达及CeRNA互作网络

陈锋 章晓云,2 陈跃平 廖建钊 周毅 李嘉骏 吴炜锋

(1广西中医药大学附属瑞康医院，广西 南宁 530011；2江西中医药大学)

骨关节炎(OA)是一种以关节软骨退变钙化、软骨下骨重塑、骨赘形成、滑膜炎症和血管侵袭为特征的慢性退行性疾病〔1～3〕。伴随全球人口老龄化的不断发展，OA发病率逐年递增，已成为全球范围内的公共健康问题〔4〕。研究表明，OA的发生与创伤、遗传、衰老、肥胖等多种因素有关，但具体发病机制尚不明确。目前临床上非手术治疗方法包括口服硫酸氨基葡萄糖、皮质类固醇、透明质酸钠、多西环素和基质金属蛋白酶抑制剂等，虽然这些药物均有不同程度的疗效，但均无法完全阻断OA的进展〔5,6〕；而手术治疗虽能矫正关节畸形、改善关节功能，但存在术后感染、血栓和二次手术等潜在风险〔7,8〕。因此，全面挖掘OA的潜在发病机制，寻找新的治疗靶点，具有非常重要的意义。

长链非编码RNA(LncRNA)是一类长度大于200nt且不能编码蛋白的RNA。首次发现时认为其没有编码功能，被定义成遗传暗物质。但近年研究证实LncRNA在生命活动过程中发挥着重要的调控作用，与疾病的发生发展密切相关〔9〕。研究表明LncRNA在OA发展过程中可作为竞争性内源RNA(CeRNA)调节微小RNA(miRNA)的表达模式和生物学特征〔10～12〕。即LncRNA可以海绵吸附miRNA来影响信使RNA(mRNA)的表达，从而参与OA的免疫反应、炎症反应、细胞代谢等生物学过程。因此本研究通过GEO数据库挖掘与OA相关的芯片,借助R语言分析差异基因,并构建LncRNA-miRNA-mRNA网络来深入研究LncRNA在CeRNA调控网络中的作用机制。……