脑胶质瘤CHSY1的表达变化及临床意义的生信分析

陈思思 邓 钢

脑胶质瘤是成人最常见的中枢神经系统肿瘤，具有侵袭性强、易复发、预后差等特点。尽管一些标志物的发现在胶质瘤的分类和诊断中发挥了重要作用，然而，当前的早期诊断和临床治疗效果仍然不理想。因此，进一步探索胶质瘤潜在的重要标志物十分重要。硫酸软骨素合成酶1（chondroitin sulfate synthase，CHSY1）是负责哺乳动物细胞硫酸软骨素生物合成的六种酶之一，其甲基化水平与T 细胞分化有关[1]。最近的研究表明，CHSY1 在多种肿瘤中表达失调，如骨肉瘤、肾透明细胞癌和结直肠癌等[2，3]。本文采用生信分析方法探讨CHSY1 在胶质瘤中的表达及临床意义。

1 资料与方法

1.1 数据获取 利用GlioVis 在线网站（http://gliovis.bioinfo.cnio.es/）获取TCGA、CGGA和Rembrandt 数据集的胶质瘤病人基因表达谱和相应的临床资料[4]，将CHSY1 的基因表达数据和对应的临床数据匹配，缺少预后信息及组织学分级的样本不纳入本研究。利用TIMER 在线网站分析CHSY1 和免疫浸润的相关性（https://cistrome.shinyapps.io/timer/）[5]。

1.2 数据分析 将CHSY1 表达量由低到高排序，前50%为低表达组，后50%为高表达组。采用Kaplan-Meier 法对CHSY1 的表达数据与匹配的生存资料进行生存分析。采用GraphPad Prism 8.01 软件进行统计分析，定量资料以±s表示，用t检验和单因素方差分析及Tukey检验；P＜0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 胶质瘤CHSY1的表达水平 胶质母细胞瘤（glioblastoma multiforme，GBM）CHSY1 表达水平显著高于正常脑组织（P＜0.05；图1A、1B），且随着胶质瘤病理分级的增加，表达水平明显增高（P＜0.05；图1C、1D）。另外，CHSY1 表达水平与胶质瘤年龄、IDH 突变及1p19q 共缺失等密切相关（P＜0.05；图1E～J）。TCGA 数据库将GBM 分为古典型、间充质型和前神经型，间充质型GBM 组织CHSY1 表达水平更高（P＜0.05；……