基于Oncomine 芯片数据库分析低密度脂蛋白受体相关蛋白4在甲状腺乳头癌中的表达及意义△

2021-10-23 07:25:48冯鑫源田昀灵傅松波邴志桐赵楠洪成恩王素媛龚文倩吴啸天
癌症进展 2021年14期
关键词:数据库差异分析

冯鑫源,田昀灵,傅松波,邴志桐,赵楠,洪成恩,王素媛,龚文倩,吴啸天

1兰州大学第一临床医学院,兰州730000

2兰州大学第一医院内分泌科,兰州730000

3中国科学院近代物理研究所,兰州7300000

甲状腺癌(thyroid carcinoma,TC)约占所有恶性肿瘤的1%,且在内分泌系统恶性肿瘤中居首位。世界卫生组织对TC 进行分型,其中甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)在人群中最常见,占75%~80%,且恶性度相对较低,临床预后较好;其次是滤泡性癌、髓样癌和未分化癌。近年来,中国TC 的发病率呈逐年上升趋势,在美国TC 已成为威胁人们生命健康的首位疾病。Hucz等研究证实,低密度脂蛋白受体相关蛋白4(lowdensity lipoprotein receptor related protein 4,LRP4)在PTC组织中的表达水平明显高于相应癌旁组织,提示LRP4 可能是甲状腺癌的致癌因子。Zhou 等通过对19 例PTC 患者进行转录组测序,发现LRP4在肿瘤组织及PTC细胞系中高表达,不同PTC细胞系中的沉默

LRP4

基因,可以抑制肿瘤细胞在组织内的侵袭和增殖,从体外实验的角度证明了LRP4作为致癌因子的作用。进一步研究发现,LRP4 主要是通过激活细胞上皮-间充质转化,从而促进PTC的转移。Oncomine 数据库是一个基于基因芯片的数据库和整合数据挖掘平台,在此数据库中可根据选题需求设定筛选和挖掘数据的条件。本研究通过筛选Oncomine 数据库中LRP4 的基因芯片信息,对相关资料进行深入挖掘分析,得出其在PTC中的表达结果及其与预后的关系,现报道如下。

1 资料与方法

1.1 数据检索

在Oncomine 数据库中进行检索,第一步设定筛选条件“Gene:LRP4”可得到LRP4 在不同肿瘤组织中的表达情况。第二步在上述检索基础上对分析类型、肿瘤类型、数据类型及参数进行限制,添加检索条件①“Analysis Type:Cancer

vs

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