氧糖剥夺再灌注后BV2细胞中差异表达关键基因的筛选及鉴定*

2022-04-21 02:19:54郭冬芬任真奎安小琼陈明孙嫚彬吴昌学禹文峰
贵州医科大学学报 2022年3期
关键词:小鼠生物差异

郭冬芬, 任真奎, 安小琼, 陈明, 孙嫚彬,吴昌学*, 禹文峰*

(1.贵州医科大学 分子生物学重点实验室, 贵州 贵阳 550004; 2.贵州医科大学 地方病与少数民族疾病教育部重点实验室, 贵州 贵阳 550004; 3.贵州省第二人民医院 检验科, 贵州 贵阳 550004; 4.贵州医科大学 儿科系, 贵州 贵阳 550004)

脑卒中是造成成人残疾与死亡的主要疾病之一,目前临床仍然没有良好的预防与治疗方案[1-2],也没有比较明确的早期辅助检测的诊断指标。转录测序是对生物基因在转录水平表达进行的大规模检测,可揭示生物在转录水平发生的差异表达。生物信息学作为一门新生学科,因为其拥有的强大数据支撑及复杂算法,近年来被广泛运用于临床医学及基础医学的数据分析中[3]。对转录测序结果进行生物信息学分析,能在一定置信度下缩小分析范围,更精准地找到研究目标。近年来,利用转录测序结合生物信息学分析,试图寻找诊断、预后和治疗脑卒中标志物,已然成为研究热点[4-6]。有研究对脑缺血再灌注小鼠脑组织进行转录测序,并通过生物信息学分析预测,发现巨噬细胞在脑缺血再灌注后的神经血管重塑中发挥重要作用[7];而对脑缺血再灌注小鼠骨骼肌进行转录测序,结果显示脑缺血性卒中小鼠模型中与蛋白水解和神经肌肉连接相关基因表达发生显著变化[8];提示即使同样是脑缺血再灌注小鼠模型,但因研究的侧重点不同,也可能会得到不同的研究发现。因此本次实验选取小鼠小胶质细胞BV2进行氧糖剥夺再灌注处理,并结合生物信息学分析,希望找出因氧糖剥夺再灌注诱导的差异表达较大的基因,以期筛选出新的分子靶点,为脑卒中的研究提供新的研究思路及方向。……

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