青花菜高温和盐胁迫相关LncRNAs的鉴定与表达特征分析

2022-06-07 02:22:10裴徐梨荆赞革罗天宽
西北农业学报 2022年5期
关键词:植物差异分析

裴徐梨,荆赞革,唐 征,罗天宽

(1.昆明学院 农学与生命科学学院,昆明 650214;2.温州科技职业学院 农业与生物技术学院,浙江温州 325006)

长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度大于200 nt且没有长开放阅读框的RNA[1]。LncRNAs在真核生物中普遍存在,其含有较少的内含子及较低的表达水平。LncRNAs根据其与相邻基因的相对位置可分为基因间LncRNAs、基因内LncRNAs及与编码序列反义LncRNAs。研究发现LncRNAs能在转录水平、转录后水平和表观遗传等层面调控生命进程[2-4]。目前,植物LncRNAs的研究相对较少,研究材料多集中在拟南芥、玉米、水稻、番茄等模式植物中。Enod40是第一个在植物中发现的LncRNA,其在蒺藜苜蓿体内发挥着重要生物功能[5]。前人通过ESTs、RNA-Seq等技术在拟南芥中鉴定得到13 000多条LncRNAs[6],研究发现这些LncRNAs参与了拟南芥的开花、逆境胁迫等多种生命进程。过表达LncRNA T5120可促进拟南芥对硝酸盐的同化,提高其生物量和根系的发育[7]。TaS1和TaS2的大量表达可以提高小麦对白粉病的抗性[8]。此外,过表达lncRNA LAIR可提高水稻产量及其邻近基因簇的表达[9]。在玉米中鉴定到3 488条LncRNAs,其中1 535条可响应干旱胁迫[10]。

高温和高盐对于青花菜的生长极为不利。青花菜花球的最佳形成温度为22 ℃,温度过高使花球形成受阻从而降低产量[11]。高盐胁迫使青花菜根系活力受到抑制,根系吸收能力下降,叶片光合作用受到严重影响[12]。因此,探讨青花菜在高温和盐胁迫下的响应机制对于青花菜生产具有重要的现实意义。

LncRNAs是转录组的重要组成部分,在植物器官发育[13]、生物[14]和非生物胁迫[15]等过程中起着重要的调控作用。……

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