新疆部分地区马疱疹病毒2型gB基因遗传变异分析

2022-11-05 03:06帕丽旦努尔兰邓海峰段汝丽贾陈阳杨恩惠田澍瑶潘娟娟佟盼盼谢金鑫
中国预防兽医学报 2022年8期
关键词:疱疹病毒结果显示引物

帕丽旦·努尔兰,邓海峰,段汝丽,贾陈阳,杨恩惠,田澍瑶,潘娟娟,况 玲,佟盼盼*,谢金鑫*

(1.新疆农业大学动物医学学院,新疆 乌鲁木齐 830052;2.伊犁哈萨克自治州昭苏马场,新疆 昭苏 835602)

疱疹病毒(Herpesvirus)属于疱疹病毒科(Herpesviridae),是有囊膜的双链DNA 病毒,可感染人类和其他脊椎动物[1],并在宿主体内建立持续性感染。根据序列同源性和基因组结构,疱疹病毒分为3 个家族(α、β 和γ),已报道能感染马属动物的疱疹病毒(Equid herpesvirus,EHV)有9 种,即EHV-1~EHV-9,属于α 疱疹病毒亚科的有EHV-1、EHV-3、EHV-4、EHV-6、EHV-8 和EHV-9,属于γ 疱疹病毒亚科的有EHV-2、EHV-5 和EHV-7[2]。其中EHV-2 又称马细胞巨化病毒,感染马后可导致流产、呼吸系统疾病、角膜结膜炎和共济失调等症状[3-7]。目前,国内仅有EHV-2 引起马驹呼吸道疾病的相关报道[8],但尚未在马流产样品中检测到该病毒。

囊膜糖蛋白B(Envelope glycoprotein B,gB)对EHV的复制至关重要,并在病毒进入细胞中发挥重要作用,常用于病毒鉴定和遗传变异分析[9]。本研究首次在国内马流产胎儿肺脏组织样品中检测到EHV-2,并对其gB 基因进行了遗传进化分析,为EHV-2 的流行病学研究提供了基础数据。

1 材料与方法

1.1 样 品2021年1月,本实验室从新疆伊犁昭苏县6个规模化马场及周边散养户采集93份马匹流产胎儿的肺脏组织,冷链运输至实验室储存于-80 ℃备用。

1.2 主要试剂病毒DNA 提取试剂盒和胶回收试剂盒购自Geneaid 公司;DL2000 DNA Marker 购自TaKa-Ra 公司;2×TransStart®FastPfu Fly PCR SuperMix 购自北京全式金生物技术有限公司。

1.3 引物设计与合成参考GenBank 中EHV-2 G9/92 株(KM924294)的gB 基因序列,利用Primer 5.0 软件设计gB 基因特异性引物:5′-GGTGACACTATAG AGATGTCRCC-3′/5′-CTGTTGATGCTCTTTCTGAGATT G-3′,引物由派森诺生物科技股份有限公司青岛合成部合成。

1.4 EHV-2 gB基因的扩增和序列分析每份肺组织样品取约0.5 g,按1∶10(w/v)加入无菌1×PBS 缓冲液低温震荡研磨后,于4 ℃、12 000 g 离心5 min,取200 μL 上清液,利用病毒DNA 提取试剂盒分别提取各样本中DNA 作为模板,利用1.3 中引物扩增gB 基因,反应条件:94 ℃2 min;94 ℃20 s、50 ℃20 s、72 ℃30 s,共35个循环,72 ℃5 min,PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测,并由上海生工生物工程技术服务有限公司测序。采用DNAStar软件对gB基因进行序列比对及分析,利用MEGA7.0.26 软件采用最大似然法(Maximum Likelihood methods)构建gB氨基酸序列系统进化树,步展值重复1 000次进行评估。

2 结果与讨论

2.1 EHV-2 PCR 检测利用gB 基因特异性引物对93份肺组织样品进行PCR 扩增,结果显示,在3份样品中扩增到716 bp 的目的片段(图1),与预期EHV-2的gB 基因片段相符;进一步测序结果显示,也均与EHV-2 gB 参考基因序列一致。EHV-2 的阳性率为3.2%(3/93)。将3 株EHV-2 gB 基因序列上传至Gen-Bank,获得登录号为OK362329-OK362331,并将这3个gB 基因所在病毒分别命名为XJ-YLZS24,XJ-YLZS28,XJ-YLZS30。已有报道显示,EHV-2是导致马流产的重要病原[7],本研究在国内首次从马早期流产胎儿样品中检测到EHV-2,提示该病毒可能主要危害孕早期马。另外,张磊等报道EHV-2引起乌鲁木齐汗血马马驹呼吸道疾病[8],表明EHV-2 可导致新疆地区马不同的临床症状。

图1 马流产胎儿肺组织样品EHV-2 gB基因的PCR扩增结果Fig.1 PCR detection of EHV-2 gB gene in aborted fetal lung tissues

2.2 EHV-2 gB 基因同源性分析利用MegAlign 软件对gB 基因分析,结果显示,本研究鉴定的3 株EHV-2之间gB基因序列和氨基酸序列的同源性分别为99.9%~100%和99.6%~100%。且该3株EHV-2 gB基因序列和氨基酸序列与澳大利亚(Aus-9 株)、巴西(EHV2-RS1 株)、德国(Ger-8 和Ger-5 株)、冰岛(Bj株)、波兰(PL_EHV2_3_I、PL_EHV2_27_V、PL_EHV2_42_IX、PL_EHV2_55_XIII 和PL_EHV2_48_X 株)、瑞士(275株)、英国(Eng-2、Eng-3和Eng-13株)和中国(CJ-31-06 和CJ-07 株)EHV-2 gB 基因和氨基酸序列同源性分别为91.6%~96.4%和90.8%~96.2%,表明EHV-2 gB基因具有遗传变异多样性。

利用CLC Sequence Veiwer 8.0 软件分析本研究鉴定的3 株EHV-2 gB 氨基酸序列和16 株EHV-2 参考株的gB 氨基酸序列,结果显示,本研究鉴定的3 株EHV-2 gB氨基酸序列均有一些位点发生了突变,且主要位于其羧基端(图2),与EHV-2新疆参考株CJ-31-06 和CJ-07 gB 氨基酸序列相比有12 个位点发生突变,分 别 为V162I、 S194P、 R195K、 R197K、 S200D、 A201T、G204V、G208N、G210E、E211G、E212A、N214Y;与其他参考株gB氨基酸序列相比有26个位点发生突变(图2),表明本研究鉴定的3株病毒(XJ-YLZS24、XJ-YLZS28和XJ-YLZS30)为新的EHV-2 变异株。Holloway 等报道EHV-2 gB 抗原表位在其氨基端[10],本研究鉴定的EHV-2 gB氨基酸突变主要位于羧基端,这些氨基酸突变是否与病毒侵入和在细胞间传播及免疫逃逸相关,需要进一步研究证实。

图2 EHV-2 gB蛋白氨基酸残基变异情况Fig.2 Variations of amino acid residues in gB protein of EHV-2

2.3 EHV-2 gB 氨基酸序列遗传进化树分析以英国、德国、波兰和我国等发现的16 株EHV-2 为参考株,利用MEGA7.0.26软件构建gB氨基酸进化树,结果显示鉴定的3株EHV-2形成独立进化分支,且与分离于波兰(PL_EHV2_42_IX、PL_EHV2_3_I 和PL_EHV2_3_I)、英国(Eng-2 和Eng-3 株)以及瑞士(275 株)亲缘关系较近,而与本实验室在马呼吸道疾病样品中发现的EHV-2(CJ-31-06和CJ-07株)处于不同分支[8](图3),表明新疆地区有两种EHV-2 在马群中流行,可分别引起马流产和呼吸道疾病。CJ-31-06 和CJ-07株来源于国外引进的汗血马,而本研究鉴定的XJ-YLZS24、XJ-YLZS28 和XJ-YLZS30 来源于新疆伊犁马,表明这3 株EHV-2 可能在伊犁马中独立循环。值得注意的是,EHV-2 gB 易发生突变,因此需进一步调查新疆地区马中流行的优势EHV-2,为疫苗开发奠定基础。

图3 EHV-2 gB氨基酸序列的遗传进化树Fig.3 Phylogenetic analysis of EHV-2 gB amino acid sequence

流产是阻碍马产业健康发展的重要因素之一,在美国、日本和欧洲等马产业发达国家,马流产率为12.2%~20.2%[11-12],本研究结果显示伊犁马流产率约为23%。目前已知引起马流产的病毒有EHV-1、EHV-2、EHV-4、EHV-5、EHV-8、马动脉炎病毒(EAV)、牛痘病毒(CPXV)、布尼亚维拉病毒(BUNV)和西尼罗病毒(WNV)[13-17]。在我国仅有EHV-1 引起马流产的报道[18-20],本实验室将进一步收集新疆地区伊犁马及其他品种马的流产样品,深入研究以明确EHV-2在新疆地区马流产样品中的流行趋势和特征,为防控EHV-2导致的马流产奠定基础。

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