内参

  • 用RT-qPCR方法评价4个不同猪品种骨骼肌候选内参基因
    有稳定表达水平的内参基因是调节和监测基因在不同处理或条件下表达变化的内在控制。因此,为了避免偏差,必须考虑RNA提取率、逆转录细节和RT-qPCR性能等几个方面[2-4]。同时,需要选择合适的内参基因来规范目的基因的表达,获得可靠、可重复的结果。理想的内参基因应在各种条件下稳定表达,选择合适的内参基因可提高基因表达检测的准确性和再现性[5]。内参基因通常被称为管家基因,由于其表达的稳定性,在分子生物学研究中最初被用作规范基因表达的参照[6-7]。这些基因如

    四川农业大学学报 2023年6期2024-01-13

  • 偏穗鹅观草RT-PCR内参基因筛选及验证
    ,这些基因被称为内参基因。理想的内参基因在植物不同生长发育阶段、不同器官中均能稳定表达,不受环境影响[8]。常见内参基因在所有细胞中均能稳定表达,通常选用基因组中的管家基因(housekeeping gene),包括肌动蛋白、微管蛋白、甘油醛-3-磷酸脱氢酶等基因。内参基因在不同物种间没有绝对的通用性,不同物种间同源内参基因的稳定性不同,同一物种中内参基因的稳定性也是相对的,不同的内参基因在不同条件下的表达通常不是恒定不变的,研究者必需结合各自的试验条件和

    中国农业科技导报 2023年6期2023-08-01

  • 柠檬色百合实时荧光定量PCR内参基因筛选
    用1个或多个稳定内参基因(Reference genes)对目的基因的表达进行均一化[11-13]。内参基因指的是在各个样品中表达恒定的基因[14],其稳定性和可靠性直接关系到目的基因表达检测结果的准确性和整体试验研究的可靠性。在不同百合种(品种)、花发育过程、花被片不同部位、不同器官及不同处理下,大多使用Actin或GAPDH(Glyceraldehyde-3-phosphatedehydrogenase)作为内参基因[15-20];在研究百合体细胞胚的

    中国农业大学学报 2023年2期2023-01-17

  • 新西兰白兔不同内脏组织中实时荧光定量PCR内参基因的筛选
    达分析则需要通过内参基因对相关数据进行归一化处理。内参基因又称管家基因,是表达量在各细胞和组织中相对稳定且不受外部环境因素和试验条件影响的基因。内参基因的表达一直被认为是稳定的。然而,相关研究表明,内参基因的表达会随着细胞生长以及发育阶段、试验条件和组织的不同而发生变化[1-3]。同时,作为维持细胞最低限度功能的基因,内参基因的稳定性也存在波动性表达。因此,直接使用未经筛选的内参基因会导致基因表达分析数据出现偏差,影响目标基因表达水平结果的可靠性。在开展试

    河南农业大学学报 2022年5期2022-12-28

  • 新舆论环境下如何提升内参工作以嘉报集团内参工作为例
    文_余延青通过内参反映情况、解决问题,是党的新闻宣传工作的一大鲜明特色。作为红船旁的党报,嘉报集团始终把《内部参考》作为新闻宣传工作的一个重要组成部分,不仅纳入各采编部门目标责任制考核,而且以批示为导向,以解决问题为落脚点,严把内参编辑审核关,确保内参刊发质量,收到较好效果。2021年以来,集团共上报内参24件,有16件得到市委、市政府领导的批示,一批内参反映的问题得到了回应、落实。下面,笔者以嘉报集团内参为例,结合编审中的体验,浅析内参面临的形势和困惑,

    传媒评论 2022年10期2022-12-26

  • 橡胶树树皮miRNA定量表达分析的内参筛选
    A定量表达分析的内参筛选吴绍华,张世鑫,杨署光,田维敏*中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海南海口 571101世界所需天然橡胶主要来自橡胶树,橡胶树的乳管是合成和储存天然橡胶的组织,树干树皮中的次生乳管与天然橡胶生产密切相关,由维管形成层分化而来。次生乳管数量与天然橡胶产量呈显著正相关。因此,乳管分化是天然橡胶生产面临的一个重大理论课题。植物m

    热带作物学报 2022年11期2022-12-16

  • 稻螟赤眼蜂实时荧光定量PCR内参基因的筛选
    行标准化处理,而内参基因是校正样本间的差异、对靶基因进行标准化处理的关键因素。同时,为减少样品之间和样品内部的误差,常用表达稳定的内参基因进行校正和标准化,因此选择合适的内参基因对其结果的准确性至关重要[6-8]。常用于定量试验的内参基因有肌动蛋白基因(Actin)、多聚泛素酶基因(Ubiquitin,UBQ)、微管蛋白基因(Tubulin,TUB)、转录延伸因子(EF1a)和泛素结合酶基因(Ubiquitin-conjugating enzyme,UBC

    中国生物防治学报 2022年5期2022-11-18

  • 猪骨骼肌内参基因的筛选及验证
    的重要工具,其中内参基因的正确选择是RT-qPCR 相对定量的重点。近年来的研究表明,不同品种、不同类型的肌肉组织以及不同时期的肌肉组织中内参基因的表达具有较大差异。如McBryan 等人发现在不同遗传背景的猪胸肌和腰肌中2-微球蛋白(Beta-2-Microglobulin,是表达最稳定的内参基因,而Niu 等人却表示在长白猪背最长肌中并不是最佳内参基因。此外,Meng 等人的研究也表明内参基因的选择对于目的基因的准确表达具有决定性作用。因此,本研究以不

    中国畜牧杂志 2022年8期2022-08-13

  • 香瓜茄多组织部位和病害胁迫条件下qRT-PCR内参基因的选择
    究均离不开稳定的内参基因[3-4]。目前,已有学者成功鉴定出多个物种不同条件下的内参基因,同时在IGG (http://icg.big.ac.cn)中已经收录了超过150种植物的多种内参基因信息[5]。在植物体中常用的内参基因包括β-微管蛋白基因(tubulin,TUB)、多聚泛素酶基因(ubiquitin,UBQ)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(glyceral-dehyde-3-phosphatedehydrogenase,GAPDH)、肌动蛋白基因(a

    青海大学学报 2022年3期2022-06-06

  • 雪茄烟叶(BESNO H382)不同组织器官及盐胁迫条件下内参基因的筛选
    确性。选择合适的内参基因是保证qRT-PCR分析结果准确性的前提[11]。常用的内参基因包括ACTIN(肌动蛋白家族基因)、RPL(Ribosomal protein L,核糖体蛋白基因)、UBQ(ubiquitin,多 聚 泛 素 酶 基 因)、EF-1 α(Elongation factors 1 alpha,转录延伸因子基因)、GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因)、

    烟草科技 2022年5期2022-05-30

  • 山麦冬果实花青素生物合成中内参基因的筛选与验证
    或多个表达稳定的内参基因(reference genes, RGs)来评估目的基因的相对表达[9]。在植物学研究中,曾以肌动蛋白(actin,ACT)[10-12]、组蛋白(histone)[11]、蛋白磷酸酶(protein phosphatase,PP2A)[13]、甘油醛-3-磷酸-脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)[12]、泛素结合酶(ubiquitin conjugating e

    浙江农林大学学报 2022年2期2022-04-08

  • 黄脊竹蝗荧光定量PCR内参基因的鉴定与筛选*
    今尚未有黄脊竹蝗内参基因筛选和鉴定方面的报道。反转录实时荧光定量PCR(real-time quantitative reverse transcription-PCR,RT-qPCR)具有定量准确、灵敏、通量大等优点,是验证基因特异性表达及研究基因功能的有效方法(Yanetal.,2012;Ibanezetal.,2016;Shakeeletal.,2018)。在RT-qPCR试验中,RNA浓度、cDNA转换效率、扩增效率等因素存在误差且无法避免,最终影

    林业科学 2022年1期2022-03-22

  • 方格星虫实时荧光定量PCR内参基因的选择与验证
    达水平相对稳定的内参基因对目的基因的表达量进行参考和校正,确保结果的可信度[7]。同一组织的内参基因的表达基本没有差别,但是不同种类、不同试验条件的内参基因表达量并不一致,用不同内参基因校正会得到不一样的结果,所以选择合适的内参基因是试验的必要前提。通过查阅相关文献并结合前期获得的方格星虫发育转录组数据库,共筛选出肌动蛋白家族(Actin1)、微管蛋白家族(α-Tub1)、核糖体蛋白(RPL13-b)、延伸因子1-α(EF1-α2)、H3-b(组蛋白)、甘

    水产科学 2022年2期2022-03-20

  • 三倍体虹鳟实时荧光定量PCR内参基因稳定性分析
    通常需选择合适的内参基因对存在的误差进行校准,选择适宜的内参基因或组合是精确计算目的基因表达水平且进行基因功能研究的关键[13-17]。理想的内参基因应该在不同组织中稳定表达[18-19],但绝对理想的内参基因是不存在的,任何一种内参基因的稳定表达都是相对的[20]。吴萍等[21]研究发现,翘嘴鳜(Sinipercachuatsi)成鱼不同组织中18S rRNA和GAPDH基因的平均稳定值最低,相对表达量最稳定;Ma等[22]研究发现,虹鳟不同组织中,β-

    水产科学 2022年1期2022-01-26

  • 酸冷胁迫下保加利亚乳杆菌定量PCR内参基因的筛选
    基因时,可通过对内参基因的监测,实现对目的基因表达状况实时监控的目的[4]。qRT-PCR 结果的准确性易受cDNA 数量与质量、RNA 质量、反转录效率、引物特异性、qRT-PCR 条件与效率等因素的影响[5]。需引入内参基因进行标准校正,以提高qRT-PCR 结果的准确性[6-7]。目前常用管家基因16S 核糖体RNA 基因(16S rRNA)、鸟苷酸激酶基因(gmk)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH)作为内参基因[8-9]。管家基因一般在生物

    中国食品学报 2021年12期2022-01-10

  • 氨氮胁迫下菲律宾蛤仔肝胰腺内参基因的筛选
    通常可以选择一个内参基因作为其他基因表达的对照,如果内参基因的表达不稳定或者是不同的实验条件下发生改变,则无法检测其他基因表达的微小变化,甚至可能导致错误的实验结果。因此,为特定的实验目的筛选合适的内参基因非常重要。理论上,内参基因的表达对维持组织细胞的生命活动是必不可少的,在细胞中的表达比较恒定。但是,研究发现在生物体不同的发育阶段、不同的组织以及不同的实验条件下基因表达水平存在很大差异[7-8]。李迪等[9]以鳜鱼6个不同组织和5个不同发育阶段为研究对

    生态毒理学报 2021年3期2021-09-23

  • 绵羊基因表达定量分析内参基因的筛选
    果,常常需要引入内参基因用以修正不同样本初始模板纯度和浓度以及反转录扩增效率等差异[3]。内参基因是一类在不同条件下仍能在所有组织内恒定表达的基因,这类基因在所有组织中都有较高的表达量[4-5]。常见的内参基因有甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH)、18S 核糖体RNA 基因(18S rRNA)、β2-微球蛋白(B2M)、beta-肌动蛋白基因(ACTβ)等[6-8]。然而,随着人们认识的深入,便发现内参基因表达并非绝对的稳定,只有在特定条件下表现出相

    中国畜牧杂志 2021年8期2021-08-15

  • 麦长管蚜miRNA实时荧光定量PCR内参基因的筛选
    ,通常需要适宜的内参基因对miRNA的定量表达结果进行校正,以便获得可靠的实验结果(Zhangetal., 2015; Wangetal., 2017)。在qRT-PCR中稳定表达的内参基因在不同物种或同一物种的不同组织、不同发育阶段和不同环境胁迫条件下也可能存在表达水平的变化(Shakeeletal., 2017; Tanetal., 2017; Lüetal., 2018),即同一个内参基因可以适用于多个实验条件,但没有一个内参基因可以适用于所有的实验

    昆虫学报 2021年4期2021-05-25

  • 铝处理下绣球实时荧光定量PCR内参基因筛选及验证
    因此,表达稳定的内参基因对于目的基因表达水平的标准化分析至关重要。最常用的内参基因包括α-肌动蛋白基因(α-actin gene,ACT)、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene,GAPDH)、18S核糖体RNA基因(18S ribosomal RNA gene,18S)、多聚泛素基因(Polyubiquitin gene,UBQ)、泛素结合酶基因(Ubiquitin conju

    华北农学报 2021年2期2021-05-07

  • 朱红毛斑蛾实时荧光定量PCR内参基因的筛选
    有关转录组分析、内参基因筛选、功能基因研究等方面尚未见报道。实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR),由于其定量准确、特异性性好和灵敏度高,广泛用于昆虫转录组验证和基因表达分析等方面的研究(Van Guilderetal.,2008;史彩华等,2017;Lüetal.,2018;Shakeeletal.,2018)。qRT-PCR技术关键因素之一为内参基因的选择。合适的内参基因可以对qRT-PCR数据进行校

    环境昆虫学报 2021年1期2021-03-30

  • 实时荧光定量PCR筛选鸡基因表达最佳内参基因
    结果的准确性受到内参基因表达量的影响,最终使目的基因表达量与真实值之间存在误差[2]。郑嫩珠等[3]研究内参基因对TYR、MITF和ASIP基因在白绒乌骨鸡各组织表达水平的影响时发现选用不同内参基因会得到不同的试验结果。张蓉等[4]在筛选蛋鸡不同组织中稳定性表达的内参基因时发现,常用的GAPDH基因在不同组织间不是稳定表达的,而RPS2和β-actin基因稳定表达。袁振杰等[5]研究表明在性发育不同阶段的济宁百日鸡下丘脑中,表达最为稳定的是GAPDH基因,

    中国农业大学学报 2021年4期2021-03-21

  • 盐胁迫下蚕豆不同组织实时荧光定量PCR内参基因的筛选
    个表达相对稳定的内参基因进行校正[2-3]。目前,植物种常用的内参基因有α/β微管蛋白基因(TUA,TUB)、参与胞质核糖体小亚基及翻译因子(18SrRNA)、肌动蛋白基因(ACT)、蛋白合成中的翻译延伸因子(GAPA)、转录延伸因子基因(EF1a)及蛋白质加工代谢相关的亲环蛋白(CYP)等[4-7]。但实际上,在不同的细胞、组织、生理阶段,目的基因的表达量可能存在差异[8],亦会因所选用的内参基因的不同而影响实验结果。近年来,关于豆科植物内参基因的报道有

    青海大学学报 2021年1期2021-03-11

  • 扇脉杓兰实时荧光定量PCR内参基因的筛选
    有必要选择合适的内参基因进行校正和标准化[4]。理想的内参基因在不同的试验条件下都会稳定表达,其表达水平与目标基因的表达水平相近[5-7]。在前基因组时代,研究者认为维持生物体生命活动或参与生物体基本代谢的蛋白基因(ACT)、微管蛋白基因(TUB)、多聚泛素酶基因(UBC)和3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)等基因产物,能在不同的细胞中或不同生理状态下稳定表达,适合作为内参基因[8-10]。然而,根据近几年的研究表明,在不同的试验条件下看家基因表达稳定

    核农学报 2021年3期2021-02-22

  • 六点始叶螨内参基因筛选及其在超氧化物歧化酶基因EsSOD表达分析中的应用
    要:為了筛选稳定内参基因分析六点始叶螨超氧化物歧化酶基因EsSOD的表达量,本研究采用geNorm、Bestkeeper、Normfinder和RefFinder软件分析6个候选内参基因actin、gapdh、rpl13、α-tub、β-tub和18sRNA在六点始叶螨幼螨、前若螨、后若螨和雌成螨中的表达稳定性。结果表明,根据geNorm软件分析得出6个候选内参引物的稳定性从大到小的排序为:actin>β-tub>rpl13>α-tub>gapdh>18s

    热带作物学报 2021年1期2021-02-22

  • 芒根组织在不同非生物胁迫下最适内参基因的筛选
    表达稳定的高质量内参基因对目的基因的表达进行校正[6]。通常,高质量内参基因可以在不同试验条件、不同组织、细胞都稳定表达,通常为看家基因[7],如 β 微管蛋白(tubulin,TUB),肌动蛋白(β-actin,ACTIN),蛋白磷酸酶 2A(Protein Phosphatase 2A,PP2A),多聚泛素酶基因(UBQ),转录延伸因子(transcription elongation factors,EF-1a)以及 18S 核糖体RNA(18S r

    四川农业大学学报 2020年6期2021-01-18

  • 茉莉花实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证
    重要技术,通过对内参基因的检测从而达到对目的基因表达情况的实时监测[1]。qRT-PCR技术具有灵敏度高、特异性强和重复性好等优点,得到了广泛应用。但该技术对样品RNA的质量、反转录的效率、内参基因选择及引物特异性等都有着非常严格的要求[2]。其中,qRT-PCR分析结果准确可靠的前提是合适内参基因的选择。常用的内参基因包括EF1α(Elongation factor 1 alpha)、Actin(Actin-7)、GAPDH(Glyceraldehyde

    华北农学报 2020年6期2021-01-08

  • 杜鹃红山茶实时定量PCR内参基因筛选及验证
    的qRT-PCR内参基因可为杜鹃红山茶基因功能研究提供理论基础和技术保障。【前人研究进展】在基因功能挖掘的过程中,基因表达模式是分析基因在物种中所起作用的重要方法之一。实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)是目前基因表达分析的主要方法之一,要确保其结果的可靠性与准确性,需要选择研究条件下适用的内参基因或组合基因来检测目的基因的相对表达量,以提高结果的可靠性。转录延伸因子的编码基因(EF1α)[4-5]、α

    广东农业科学 2020年12期2020-11-20

  • 藜麦内参基因筛选及盐胁迫相关基因表达分析
    为稳定的基因作为内参基因,通过稳定表达的内参基因对检测基因的表达进行校正及标准化分析[3].筛选特定物种、或者在特定处理中稳定表达的内参基因是进行荧光定量实验的前提[4-5],目前基于常用的geNorm、NormFinder和Bestkeeper3种分析方法,可以筛选出特定实验条件下表达稳定的内参基因[6-7].藜麦(Chenopodiumquinoawilld)是苋科、藜亚科、藜属的一年生自花授粉双子叶植物,具有耐寒、耐旱、耐瘠薄、耐盐碱等特性[8],其

    烟台大学学报(自然科学与工程版) 2020年3期2020-08-26

  • 牛樟芝不同发育阶段菌丝体实时荧光定量PCR中内参基因的筛选
    析中,选择合适的内参基因是衡量样品表达量和准确性的重要前提和保障。本研究以液体发酵7、21、35 d的牛樟芝菌丝体为样本,采用qRT-PCR技术检测牛樟芝菌丝体内Actin、TPK、Floxuridine、CAP-Gly、α-Amylase、Phosphatase、HA2-helicase、MAGT1等8个候选内参基因在3组样本中的表达水平,采用geNorm、NormFinder、BestKeeper 3個软件对其分别进行稳定性比较和评价。结果表明,geN

    热带作物学报 2020年6期2020-08-04

  • 莲草直胸跳甲不同发育阶段内参基因的筛选与验证
    真实可靠性常受到内参基因、模板质量、反转录与扩增效率等因素的影响,关乎研究基因的差异表达判断的准确性[3,4]。因此,为了减少试验误差,选择合适的qPCR 数据标准化方法至关重要,但也存在很多困难[4,5]。使用稳定表达的内参基因是目前最常用的qPCR 数据标准化方法之一,特别是使用2-ΔΔCt方法时,内参基因的选择尤为重要[4,6]。理想的内参基因应该不受实验过程和条件的影响,具有高表达,并且在不同处理和组织中表现出相似的、稳定的表达水平[7]。一些传统

    山西农业大学学报(自然科学版) 2020年4期2020-07-09

  • 连翘花器官生长阶段内参基因筛选与评估
    果不准确,而利用内参基因可校准样品间误差[2],降低研究结果的不科学性。植物表达研究一般以管家基因作为内参基因[3],认为它们在生命活动中起重要作用且表达稳定,常常不经过验证就直接使用。但有研究表明,植物在不同试验环境、生长阶段以及组织部位的不同会导致内参基因存在差异[4]。如核桃不定根发生阶段以ACT2 为内参基因[5],而核桃不同组织间则以18S 基因为内参[6]。因此,植物在特定的环境与生长阶段需要筛选最适内参基因。常用评价内参基因表达稳定性的软件有

    山西农业科学 2020年3期2020-03-26

  • 甜樱桃花芽不同发育时期内参基因的筛选与验证
    性,因此,通常用内参基因对其数据进行校正[6]。内参基因通常是组织或器官中一些表达相对恒定的持家基因[7],但并不是所有持家基因均可以作为内参基因。因此,需根据具体实验需要,对不同组织[7]、不同实验条件[8]或不同发育时期[9]进行内参基因筛选。因地域和气候的不同,甜樱桃花芽发育过程中一些花芽发育相关基因的表达可能会发生变化,进而可影响花粉和雌蕊的发育。而这些花器官的发育则影响果实的发育,最终影响甜樱桃产量。因此研究花芽发育相关基因表达情况对提高甜樱桃产

    种子 2020年2期2020-03-12

  • 苯酚胁迫下多刺裸腹溞实时定量PCR内参基因的筛选
    前提是需要稳定的内参基因。内参基因是指在对某一个目的基因进行定量研究时, 在实验条件下待测样品中表达相对恒定的一类基因, 其作用是校正目的基因的定量过程[6]。常用的内参基因大多是管家基因(House-keeping gene), 包括编码组蛋白基因、线粒体蛋白基因、编码核糖体蛋白基因、生物代谢途径中各种关键酶的基因等, 如rRNA、β-actin、cyclophilin、hsp、gapdh、rpl13等[7]。这些管家基因大多参与了生物体基本代谢活动,

    水生生物学报 2020年1期2020-03-04

  • 小鼠脂肪沉积过程中定量PCR内参基因的筛选
    的技术,但不同的内参基因可能导致的定量结果差异较大,偏离体内基因表达的真实水平,因此选择稳定的内参是基因相对定量分析的关键[1]。脂肪组织常用内参基因包括β2-微球蛋白(B2M)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(Gapdh)、β肌动蛋白(β-actin)、β-微管蛋白(β-tubulin)、亲环蛋白A(PPIA)、琥珀酸脱氢酶复合物亚单位A(SDHA)等基因。近年来的研究结果发现,在不同组织和细胞类型、细胞增殖分化不同阶段、体外培养等情况下这些内参基因的表达量通常

    中国兽医学报 2020年12期2020-02-24

  • 新媒体环境下新闻内参面临的挑战及应对
    陈思妤一、新闻内参的起源与发展中国最早的内参可追溯至古代社会。从汉朝的“密奏”、唐宋时期的“上封”、“实封”到清代的“折子”,虽名称各不相同,但实际上行使的都是“内参”的职责,既向皇帝献言献策,又要传报各地政情和有关国计民生的大事。建国以前,我国内参机制中行使职能的就是新闻内参,均由新华社创办,一份是1931年创刊的《参考消息》,另一份是1949年创刊的《内部参考》。前者主要报道国际新闻,属于仅限党内高层干部阅读的秘密级刊物;后者用来反映国内情况,供中央

    新闻前哨 2019年10期2019-11-17

  • 不同光周期和温度处理下桂花内参基因的筛选
    到适合不同研究的内参基因格外重要。研究认为[10-11],内参基因并不存在通用性,不同处理、不同组织中内参基因的表达水平都会发生改变[12];选用一种内参基因无法准确反映不同植物组织、同一组织不同处理下的基因表达水平[13-14]。因此,根据具体的实验材料和处理条件筛选合适的内参基因十分必要[15]。光周期和温度处理能对桂花的基因表达水平、花芽分化进程等产生影响。研究表明[4,16]:长日照和相对低温都能够加快桂花花芽分化进程,而短日照条件下桂花的花芽分化

    浙江农林大学学报 2019年5期2019-09-25

  • 景宁木兰热胁迫下实时荧光定量PCR内参基因的筛选
    ],因此需要引入内参基因对基因表达结果进行校正和标准化以消除背景误差的影响[4]。理想的内参基因是指在不同的组织,不同时期,不同环境条件下甚至是不同植物下皆可相对稳定表达的基因。它们是构成细胞的基本转录组成分,参与维持细胞的基本功能,且与要分析的目标基因具有相似的表达水平[5]。但大量实验研究表明,许多内参基因的转录水平会因为植物的发育阶段或实验条件的不同而出现差异,这种差异会影响试验结果的准确性,甚至得出错误的结论[6-7]。因此,在进行qRT-PCR试

    浙江农林大学学报 2019年5期2019-09-25

  • 嫁接西瓜在不同营养胁迫下最适内参miRNA的鉴定
    手段,选取合适的内参基因来排除误差是取得可靠的表达结果的前提。由于分子结构和表达特征的相似性,miRNA或者其它小分子RNA比较适合作为miRNA表达分析的内参。因此,本研究旨在筛选出在正常养分条件和氮,磷营养胁迫下,以及在嫁接西瓜接穗和砧木(南瓜,葫芦)中进行miRNA定量分析的内参基因,为研究miRNAs在嫁接西瓜中调控养分胁迫响应中的功能奠定基础。材料与方法: 以西瓜‘早佳为接穗,以葫芦‘甬砧1号和南瓜‘非常辅佐为砧木。西瓜嫁接、自嫁和实生苗培养在

    中国瓜菜 2019年8期2019-09-19

  • 天府肉鹅母系不同阶段颗粒细胞内参基因的选择
    要引入稳定表达的内参基因予以校正[2]。理想的内参基因应该是在所研究的组织、细胞和各种实验条件下均能够恒定表达的基因[3]。但是,由于内参基因的表达具有物种、组织及阶段特异性,不存在通用于多种细胞、组织和实验条件的内参基因。如若使用未经筛选验证的内参基因进行校正,则目标基因表达水平的定量分析可能出现较大的偏差[4]。因此,需要根据细胞和组织类型、细胞增殖和器官发育的阶段、实验条件的不同,筛选出相对合适的内参基因及确定其数目,对数据进行校正和标准化,以获得准

    浙江大学学报(农业与生命科学版) 2019年3期2019-07-08

  • 毛泽东内参批示研究(1965—1976)
    “文化大革命”;内参;《毛泽东年谱》;《建国以来毛泽东文稿》摘要:“文化大革命”期间的重大事件几乎都与内参有联系,有的甚至是内参引发的。阅读各种内参,是毛泽东了解“文革”进程及细节,并作出重大决策的重要途径。毛泽东在“文革”期间阅读和批示过的内参有30余种,这些内参包括媒体报送的内参、中央办公厅和中央文革小组报送的内参、中央各部门报送的内参、军队系统报送的内参,以及私人来信。毛泽东的内参批示,几乎篇篇都有特色,篇篇都体现了他的治国理政思想及策略方式,是毛泽

    安徽师范大学学报 2019年3期2019-05-25

  • 二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价
    时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价徐红星1王国荣2鲁艳辉1,*杨亚军1郑许松1田俊策1吕仲贤1,*(1浙江省农业科学院 农业部农产品信息溯源重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地, 杭州 310021;2杭州市萧山区农业技术推广中心, 杭州 311202;*通讯联系人: luyanhui4321@126.com; luzxmh@163.com)【目的】筛选特定试验条件下二化螟()稳定表达的内参基因,为二化螟基因表达研究奠定基础。【方法】根据二

    中国水稻科学 2019年1期2019-01-24

  • 交通场景中的相机标定方法研究
    键词:相机标定;内参;外参;相机成像模型相机标定[1]就是计算机视觉中从三维空间中的世界坐标系转换到二维图像中的图像坐标系的过程。交通场景中存在很多可以利用的信息,比如道路标志线、指示牌等;本文主要针对复杂的交通场景研究了适用于交通场景的相机标定方法,并总结了各自的特点。1 小孔成像模型首先,常用的相机成像模型是小孔成像模型,而在此模型下的相机标定主要是求解世界坐标系、相机坐标系和图像坐标系之间转换关系,可以表示为:λuv1=KRTXWYWZW1(1.1)

    科技风 2018年11期2018-05-14

  • 模拟增温下短花针茅实时荧光定量内参基因的筛选及验证
    要筛选表达稳定的内参基因作为标准[2-3]。在基因定量表达的研究中,通常选用看家基因(House-keeping gene)作为内参基因,因为看家基因是全部细胞中均要表达的一类基因,其产物对于维持细胞各种基本生命活动是必需的,比如常用的糖酵解酶系基因、微管蛋白基因和核糖体蛋白基因等。一般认为看家基因的表达只受机体RNA聚合酶或启动子相互作用的影响,并不受其他机制调节,看家基因的表达受环境因素的影响较小。但随着研究的深入,发现看家基因在不同组织部位或者不同处

    草地学报 2017年5期2017-09-13

  • 羊草不同组织实时定量PCR内参基因的筛选
    织实时定量PCR内参基因的筛选胡宁宁1,2,郭慧琴3,李西良1,孔令琪1,武自念1,张继泽1,常 春1,万东莉1,臧 辉1,2,任卫波1 (1.中国农业科学院草原研究所,内蒙古 呼和浩特 010010; 2.中国农业科学院研究生院,北京 100081;3.内蒙古农业大学生命科学学院,内蒙古 呼和浩特 010018)为筛选羊草(Leymuschinensis)不同组织实时定量PCR(qRT-PCR)试验体系中的最佳内参基因,以羊草叶、茎、根、穗为研究材料,利

    草业科学 2017年7期2017-08-11

  • 授粉后红球姜雌性生殖器官qRT-PCR的内参基因筛选
    qRT-PCR的内参基因筛选林浩川, 钟春梅, 孙姝兰*(华南师范大学生命科学学院,广东省植物发育与生物工程重点实验室,广州 510631)根据授粉后不同时间点的红球姜转录组数据库以及相关文献报道的传统内参基因,筛选出10个表达相对稳定的基因Actin-2(ACT2)、Actin-7(ACT7)、Betatubulin-1(TUB1)、Betatubulin-5(TUB5)、Alphatubulin-3(TUA3)、Ubiquitin(UBQ)、Glyce

    华南师范大学学报(自然科学版) 2017年1期2017-04-12

  • 利用表达谱芯片数据筛选不同表达丰度的内参基因
    选不同表达丰度的内参基因胡世贤,陆佳涛,徐福意,晁天柱,周梁良,李凯,周宇荀,肖君华*(东华大学生物科学与技术研究所,上海 201620)目的 基于表达谱芯片的检测结果,筛选多个内参基因,用于小家鼠肝脏组织中具有不同表达丰度基因的定量检测。方法 应用表达谱芯片技术,完成小鼠肝脏组织的表达谱检测;依据基因表达丰度将基因分为3组,并进一步通过变异系数(coefficient of variation, CV)组内筛选候选内参基因;采用实时荧光定量PCR技术(r

    中国实验动物学报 2017年1期2017-03-13

  • 藜科植物藜和灰绿藜实时荧光定量PCR内参基因的选择
    时荧光定量PCR内参基因的选择刘艳霞1, 兰欣欣2, 曹 婧2, 张晶华2, 兰海燕2*( 新疆大学 生命科学与技术学院/新疆生物资源基因工程重点实验室, 乌鲁木齐 830046 )选择合适的内参基因是实时荧光定量PCR(qRT-PCR)研究的关键,目前对藜科耐盐(盐生)植物胁迫相关基因的表达分析中所用内参基因的报道较为有限。该研究利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper 3个内参基因分析软件,对已选择过的β-TUBULIN、β-ACT

    广西植物 2016年12期2017-01-04

  • 桂花组织基因表达中荧光定量PCR内参基因的筛选
    中荧光定量PCR内参基因的筛选付建新1,张超1,王艺光1,赵宏波1,2(1.浙江农林大学 风景园林与建筑学院,浙江 临安 311300;2.浙江农林大学 亚热带森林培育国家重点实验室培育基地,浙江临安311300)为了筛选桂花Osmanthus fragrans不同组织基因表达分析中适合的内参基因,以桂花 ‘堰虹桂’O.fragrans ‘Yanhong Gui’花蕾、盛开花序、嫩叶、成熟叶和1年生茎等5个不同组织为材料,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(q

    浙江农林大学学报 2016年5期2016-10-27

  • 大豆Pre-miRNAs作为内参基因在盐碱胁迫下的表达稳定性分析
    miRNAs作为内参基因在盐碱胁迫下的表达稳定性分析周永刚1a,1b,王骐2,刘伟灿1a,1b,邓宇1a,1b,李晰亮1a,1b,靳京1a,1b,邓文波1a,1b,赵利旦1a,1b,王兴超1a,1b,王南1a,1b,王法微1a,1b,李晓薇1a,1b,董园园1a,1b,李海燕1a,1b(1 吉林农业大学 a生物反应器与药物开发教育部工程研究中心,b生命科学学院,吉林 长春130118;2 东北师范大学 附属中学,吉林 长春 130118)[摘要]【目的】

    西北农林科技大学学报(自然科学版) 2016年1期2016-06-03

  • 基于内参的志贺氏菌实时荧光定量PCR快速检测
    0051)基于内参的志贺氏菌实时荧光定量PCR快速检测王建昌,王金凤,李静,孙晓霞,陈瑞春* (河北省出入境检验检疫局检验检疫技术中心,河北石家庄050051)摘要:根据Genbank已公布的志贺氏菌基因组序列,筛选特异性靶基因ipaH,设计特异性引物和探针,优化反应体系,并在体系中加入内参(IAC),通过标记不同荧光基团的TaqMan探针来监测IAC,进而实时监控整个PCR反应过程。按照人工污染样品,以评价所建立反应体系的性能。以志贺氏菌基因组DNA为

    食品与生物技术学报 2016年1期2016-05-23

  • 天蓝苜蓿锌胁迫下实时定量PCR内参基因筛选
    下实时定量PCR内参基因筛选张德辉,孙亚丽,赵 亮,丑敏霞*(西北农林科技大学生命科学学院,旱区作物逆境生物学国家重点实验室,陕西杨凌 712100)选取8个管家基因(h2a、act、18s、tub、ubi、ef1、cyp、gapdh)作为候选内参基因,以不同浓度Zn2+处理下接菌第30d的天蓝苜蓿(Medicago Lupulina L.)接种根为实验材料,筛选用于目的基因实时荧光定量PCR分析的最佳内参基因.研究表明:候选内参基因平均表达稳定性由高到低

    中国环境科学 2015年3期2015-11-18

  • 转型期内参机制面临的挑战及应对
    是在一份新华社“内参”上作出的,内容是“坚决杜绝公款浪费”。对于内参的作用,胡锦涛同志曾将之比作“中央的智囊团和思想库”。内参即内部参考资料,是有着多种秘密等级、只供相应级别官员阅读,旨在为决策层提供参考的一种新闻形式。内参报道是我国新闻传播体制所特有的信息传播手段,它的真实度、敏感度、深度均甚于公开报道,一直是党和政府治国理政的重要工具之一。互联网时代的今天,我国传媒业正发生着深刻变革,新媒体迅速兴起并得到快速发展,传统媒体坚守阵地并积极探索转型。随着社

    新闻前哨 2014年10期2014-12-13