许龙岩,袁慕云,林文丽,张 旺,焦 红
(广东出入境检验检疫局技术中心食品实验室, 广东 广州 510623)
DiversiLab系统沙门氏菌分子分型评价
许龙岩,袁慕云,林文丽,张 旺,焦 红
(广东出入境检验检疫局技术中心食品实验室, 广东 广州 510623)
目的:评价DiversiLab(DVL)系统对沙门氏菌(SA)的分型能力。方法:用rep-PCR技术为原理的DVL系统对进出口食品中分离的44株SA进行分子分型,并与脉冲场凝胶电泳(PFGE)结果比较,探讨DVL对SA的种群分类能力和分辨率。结果:44株SA经rep-PCR分型分成22个群,分离自不同国家、不同食品中的相同血清型SA分布在同一个群,而且菌株之间相似性非常高。在rep-PCR结果中分在同一个群中的SA,在PFGE结果中除SA2和SA15外,其他菌株之间相关性较低。结论:DVL在SA的种群的分类能力上优于PFGE,但分辨率低于PFGE。
沙门氏菌;DiversiLab系统;rep-PCR;PFGE;分子分型
基因外重复回文序列(repetitive ext ragenic palindrome,rep)在细菌基因组中存在着菌株、种、属水平上的分布和拷贝数量的差异,而序列本身在进化过程中又具有较强的保守性,非常适合作为PCR引物的扩增对象。在rep的中心有一段保守性很高的重复序列,根据这段重复序列设计引物,扩增两段rep之间的片段,发展出了rep-PCR技术[1]。DiversiLab(DVL)是以rep-PCR技术为原理的自动化的分子分型系统。本研究用DVL对食品中分离的沙门氏菌进行rep-PCR分型,并与脉冲场凝胶电泳(PFGE)结果相比较,探讨DVL对SA的分型能力,为DVL应用于SA的溯源工作提供参考数据。
1.1 菌株
进出口食品中分离的SA 44株,菌株信息见表1。上述菌株为广东出入境检验检疫局技术中心食品实验室和中国检验检疫科学研究院食品安全研究所保存菌株,所有菌株均经过API 20E生化鉴定确定为SA。……