李君,孙淑军,王洋,刘才峰,仲兴阳,徐峰,蔡志刚,张永煜,4**
(1.第二军医大学东方肝胆外科医院上海200438;2.上海交通大学药学院上海200240;3.上海中医药大学中医方证与系统生物学研究中心上海201203;4.滇西应用技术大学傣医药学院西双版纳600100;5.上海通微分析技术有限公司上海201203;6.上海中医药大学附属曙光医院上海201203)
29例肝细胞肝癌患者的肿瘤组织代谢组学研究*
李君1,孙淑军2,5,王洋3,刘才峰1,仲兴阳1,徐峰1,蔡志刚6,张永煜3,4**
(1.第二军医大学东方肝胆外科医院上海200438;2.上海交通大学药学院上海200240;3.上海中医药大学中医方证与系统生物学研究中心上海201203;4.滇西应用技术大学傣医药学院西双版纳600100;5.上海通微分析技术有限公司上海201203;6.上海中医药大学附属曙光医院上海201203)
目的:运用组织代谢组学方法,探讨肝细胞肝癌的发病机制与治疗策略。方法:采用GC-MS分析肝细胞肝癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)患者癌组织和癌旁组织中的内源性小分子代谢产物,进行单维和多维统计分析,寻找差异代谢物。通过KEGG和HMDB数据库检索和分析,获得相关代谢通路。结果:经PCA、PLS-DA分析得知癌组织和癌旁组织的代谢轮廓具有显著性差异,经OPLS-Loading plot分析寻找到25个差异性代谢产物,与之相关代谢通路有36条,多属于糖代谢、氨基酸代谢和线粒体转移代谢。25个差异物中ROC曲线下面积大于0.8的差异物有16个,经分析该16个差异物与三磷酸腺苷结合盒(ATP-binding Cassette,ABC)转运体代谢、半乳糖代谢、氨基糖和核苷酸代谢有关。结论:肝癌组织细胞中存在沃伯格效应(Warburg effect),即糖酵解异常增强,三羧酸循环减弱。……