基于MiSeq高通量测序技术奶疙瘩细菌群落结构研究

倪慧，葛东颖，杨甜甜，单春会，佘雅倩，肖石高，郭壮

（1.湖北文理学院 湖北省食品配料工程技术研究中心，湖北 襄阳441053；2.石河子大学 食品学院，新疆 石河子832003；3.湖北澳利龙食品股份有限公司，湖北 宜昌443000）

0 引言

作为我国传统酸凝奶酪的一种，奶疙瘩是哈萨克族和蒙古族等少数民族传统特色奶制品，具有咸酸的口感并保留了大量牛奶中的天然营养成分[1]。奶疙瘩可分为干湿两类，将酸奶用纱布挤掉乳清即为湿奶疙瘩，而将湿奶疙瘩风干后即为干奶疙瘩。作为自然发酵奶制品，奶疙瘩中微生物类群的丰度和多样性均较高，且以乳酸菌为主[2]。Illumina MiSeq高通量测序技术具有测序深度广、测试样本量大和准确性高的优点[3]，广泛用于酸奶[4]、奶酪[5]和原料乳[6]等乳制品微生物多样性的解析中。

作为万顷荒漠中的绿洲，新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州具有塞外江南的美誉，盛产奶疙瘩和酸马奶等多种发酵乳制品，独特的环境可能赋予了其发酵乳制品独特的微生物群系。本研究采用Illumina MiSeq高通量测序技术，对采自伊犁地区的干奶疙瘩样品，进行基于细菌16S rRNA基因V3-V4可变区的测序，并对细菌类群的基因功能进行了注释，以期为后续新疆地区奶疙瘩的工业化生产和传统发酵乳制品的微生物解析提供数据支持。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

1.1.1 材料

干奶疙瘩，新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州。

DNeasy mericon Food Kit提取试剂盒，德国QIAGEN公司；引物338F/806R，武汉天一辉远生物科技有限公司；DNA聚合酶、dNTPs mix和PCR缓冲液，宝生物工程大连有限公司；……