膜联蛋白A2在神经胶质瘤中的表达及调控表型关键基因的生物信息学分析*

2021-01-13 07:46:34谢守嫔颜伟姗周迎霞彭小兰李海龙
国际检验医学杂志 2021年1期
关键词:生物信号分析

谢守嫔,颜伟姗,王 瑛,周迎霞,彭小兰,李海龙

甘肃省兰州市第一人民医院:1.神经科;2.感染管理科,甘肃兰州 730050;3.兰州大学第二医院放射影像科,甘肃兰州 730030;4.甘肃中医药大学第一临床医学院,甘肃兰州 730000

膜联蛋白A2(ANXA2)是一种钙依赖性磷脂结合蛋白,在脊椎动物细胞中广泛表达。有研究表明,ANXA2在人神经胶质瘤等多种肿瘤细胞中异常高表达,且其表达与预后不良有关,是胶质瘤独立预后指标[1-4]。据报道,沉默ANXA2可抑制胶质瘤细胞株U251和U87的增殖,相反,上调ANXA2的表达可以促进U251细胞增殖[4]。沉默ANXA2可抑制信号传导与转录激活因子3和细胞周期蛋白D1的表达,将细胞周期阻滞在G1~S期[5]。研究表明,ANXA2参与恶性胶质瘤的血管生成、侵袭和转移[6-7]。ANXA2的泛素化和降解,S100钙结合蛋白A11(S100A11)与ANXA2相互作用,参与调节核因子κB(NF-κB)信号通路。此外,NF-κB在转录水平上正向调节S100A11,证明了S100A11在神经胶质瘤生长中的作用。为进一步明确ANXA2在神经胶质瘤中的表达及参与胶质瘤恶性表型形成的机制,本研究拟借助于生物信息学软件,分析ANXA2在神经胶质瘤中的表达、预后及其相关信号通路的分子机制。

1 资料与方法

1.1ANXA2基因在人胶质瘤及癌旁组织中的表达分析 选择基于癌症基因组图谱数据库的生物信息学分析软件开展ANXA2在胶质瘤及癌旁组织的表达分析,这些在线软件包括:UALCAN(http://ualcan.path.uab.edu/analysis.html),ONCOMINE(https://www.oncomine.org/resource/login.html)和GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/)。

1.2ANXA2基因在人胶质瘤组织异常表达的生存分析 利用在线分析网站Human protein atlas(https://www.proteinatlas.org/)对ANXA2基因分别在高表达和低表达胶质瘤患者中的临床样本进行无病生存期和总生存期分析。……

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