蛋白酶K预处理在SARS-CoV-2核酸提取中的应用探讨*

2021-01-13 07:46:34巫丽娟宋兴勃叶远馨钟慧钰周汶静陶昕彤刘堂喻亨宋佳佳斯艳君陆小军应斌武
国际检验医学杂志 2021年1期
关键词:检测研究

王 念,巫丽娟,周 易,宋兴勃,叶远馨,钟慧钰,周汶静,陶昕彤,刘堂喻亨,宋佳佳,斯艳君,陆小军,应斌武

四川大学华西医院实验医学科,四川成都 610041

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的迅速传播,已严重危害人类健康。早期实验室诊断可及时隔离新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者及其密切接触者,打破传播链[1-2]。同时,早期诊断和治疗可使患者有更好的结局[3]。大多数临床实验室采用实时荧光定量PCR(qPCR)对SARS-CoV-2进行核酸检测[4]。然而,SARS-CoV-2核酸检测的阳性率并不高。其中,核酸提取效率是影响其检出率的重要因素之一。因为蛋白酶K(PK)可对生物标本中的蛋白质进行消化,同时还可降解标本中的RNA核酸酶,阻止RNA被降解,对标本进行PK预处理可能会提高核酸的提取效率,从而降低其循环阈值(Ct值),提高阳性检出率。因此,本文就核酸提取前预处理是否需要加入PK进行探讨。

1 材料与方法

1.1标本来源 选取本院2020年1月25日至6月30日临床上收集的COVID-19患者(根据SARS-CoV-2相关指南确诊)[4]的核酸阳性标本共70份,其中包括50份鼻咽拭子标本和20份粪便标本。

1.2仪器与试剂 鼻咽拭子含植绒拭子及3 mL保存液购自深圳海尔施生物医药股份有限公司;病毒RNA提取采用NucliSENS easyMAG磁珠提取系统(购自法国生物梅里埃公司);PK试剂购自瑞士罗氏公司;SARS-CoV-2检测试剂购自湖南圣湘生物科技股份有限公司,采用SLAN-96P仪(购自上海宏石医疗科技有限公司)进行qPCR扩增。

1.3标本处理与提取 所有标本先经过56 ℃、30 min 灭活。 鼻咽拭子标本:取出标本后混匀保存液,分别取2份1 mL待测标本于1.5 mL小型离心管中,其中1份加入50 μL PK(20 mg/mL),56 ℃下孵育30 min,另1份则直接在56 ℃下孵育30 min。……

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