苏尼特羊不同生长时期肌肉组织lncRNA的差异表达分析

王瑞雪 刘佳森 李蕴华 成立新 岳林芳 马万山 赵艳红

(1.内蒙古自治区农牧业科学院 畜牧研究所，呼和浩特 010031；2.内蒙古农业大学 动物科学学院，呼和浩特 010018)

lncRNA作为2012年度新兴起的生命科学研究之一[1]，在生物众多生命活动中起着至关重要的调控作用，是继mRNA和miRNA之后最热门的分子生物学研究领域之一。lncRNA 是一类长度均>200 nt且不具备或很少具有蛋白质编码能力的 RNA[2]，并缺乏明显的开放阅读框。最初有研究认为 lncRNA 是基因组转录过程中形成的“噪音”，在生物体内不发挥任何生物学功能[3]。但近期的研究表明，lncRNA可参与细胞核和细胞质中的 X 染色体失活、染色体结构改变、基因印记、转录激活/沉默和核内运输等关键生命活动[4]。Cesana等[5]通过研究人和小鼠的骨骼肌生长发育时发现，特异性表达的长链非编码 RNA linc-MD1可以结合miR-133和miR-135来调控肌肉特异性基因MAML1和MEF2C的表达。Zhu等[6]研究发现，lnc-mg 通过结合miR-125b调控骨骼肌发生的关键调节因子-IGF2的蛋白质水平，进而调节肌肉的生长发育。近年来，在畜禽领域逐渐开展了lncRNA的相关研究。Ren等[7]在猪的胎儿滋养层鉴定出一种新的lncRNA，发现其在猪胎儿骨骼肌中表达上调，并显著影响猪胎儿骨骼肌的发育。Li等[8]通过RNA-seq技术和生物信息学分析方法，在鸡基因组中鉴定出281种与鸡骨骼肌发育相关的新lncRNA。

绵羊肌肉发育相关的lncRNA研究正处于起步阶段，刘瑞凿等[9]利用转录组测序技术对乌珠穆沁羊和特克赛尔羊腓肠肌进行lncRNA测序，发现lncRNA TCONS_00102859只在特克赛尔羊腓肠肌中表达，并且随着发育其表达量逐渐增高。进……