基于生物信息学途径筛选缺血性脑卒中关键基因及药物预测

2021-02-24 11:41:20王钟兴
中山大学学报(医学科学版) 2021年1期
关键词:小鼠差异分析

于 瑜,王钟兴

(中山大学附属第一医院麻醉科,广东广州 510080)

脑卒中作为全球第二大死亡原因,严重危害人类健康。全球每年约有550 万人死于脑卒中,每4个成年人中就有1人发病[1]。发病后遗留的身体残疾和神经功能障碍给中风幸存者的家庭及社会造成极大负担。在脑卒中病例中,缺血性脑卒中(以下简称脑缺血)约占70%,是脑卒中的主要类型[1]。目前,临床上脑缺血的主要治疗方法包括脑血管再通和神经保护。遗憾的是,这些措施收益有限。为了找到更有效的治疗方式以及治疗靶点,许多科学家从遗传学角度出发,寻找与脑缺血密切相关的基因,希望为治疗提供更多选择。例如:有研究人员利用高通量组学技术发现CLDN20、GADD45G、RGS2、BAG5 和CTNND2 可以作为小鼠和人类血液样本中脑缺血的血液生物标记物,协助脑缺血的临床诊断[2]。MAP2K4(丝裂原活化蛋白激酶4)是MAPK 通路的重要枢纽,MAP2K4 基因多态性rs3826392 可能在脑缺血后的炎症反应中发挥调节作用[3]。这些从基因层面解读脑缺血病理生理过程的研究对治疗方案的研发有一定启迪作用。因此,本研究借助生物信息学手段,通过对公共数据库的分析,寻找对缺血性脑卒中有重要作用的基因及相关通路,希望找到潜在治疗药物,能为缺血性脑卒中的进一步研究和后续治疗提供线索。

1 材料与方法

1.1 数据收集

大脑中动脉栓塞(middle cerebral artery occlu⁃sion,MCAO)是研究缺血性脑卒中的常用动物模型,可精确控制缺血时长。本研究选择GEO 数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中 研 究MCAO 小鼠表达谱变化的芯片集GSE98319。……

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