王亚楠, 张 文
(江苏大学医学院,江苏 镇江 212013)
据统计,全球≥5岁儿童严重肺炎的病死率为8.9%[1],包括肺炎在内的严重急性呼吸道感染是儿童入院和死亡的主要原因[2]。在我国,呼吸道感染占儿科门诊的绝大部分,其中80%是呼吸道病毒感染[3]。目前,临床上常见的病毒主要有流感病毒(influenza virus,Inf)、副流感病毒(parainfluenza virus,PIV)、合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)和腺病毒(adenoviridae,ADV)等[4]。病毒的暴发性传染会给公众,尤其是免疫功能尚不健全的儿童带来巨大的威胁。如果能对环境中潜伏的呼吸道病毒进行有效的监测,及早发现具有致病性的未知病毒,或已知病毒的变异株,对疫情防控有很高的价值。
目前,临床常规的病毒检测方法有聚合酶链反应(polymerase chain reaction ,PCR)、细胞培养法、扫描电镜检测法、特异性抗体检测法[5],但是传统方法都各有无法避免的缺点,最大的弊端是只能检测已经发现的病毒,很难检测新型病毒[6]。随着科学技术的不断进步,病毒宏基因组学逐渐成为非培养的高通量病毒核酸检测的最佳选择,其突破了传统方法的局限性,直接以环境中所有病毒的遗传物质作为研究对象,可快速鉴定出环境中所有病毒的组成,从而发现新病毒,监测病毒的变异情况。本研究采用病毒宏基因组学方法,分析上呼吸道感染患儿鼻腔微环境病毒群落的组成,从而为儿童上呼吸道病毒感染的预防及临床治疗提供帮助。
收集2013年7月—2014年6月江苏大学附属医院100份1~6岁上呼吸道病毒感染患儿鼻黏膜分泌物拭子样本。……