VSIG4在乳腺癌中的表达及其与免疫浸润和 预后的相关性

宋文静，刘姝婷，贺鑫，龚鹏举，杨燕，魏蕾，张京伟

0 引言

乳腺癌（breast cancer,BC）是全世界最常见的恶性肿瘤之一，据预计，2020年美国的乳腺癌女性患者将占所有女性癌症患者的30%（276 480）和癌症死亡人数的15%（42 170）[1]。然而，仍然缺乏有用的乳腺癌免疫治疗生物标志物。因此，急需识别和转化乳腺癌新的免疫相关分子标志物和治疗靶点。

肿瘤与人体免疫系统之间的相互作用在肿瘤的发生发展和诊疗中起着至关重要的作用。肿瘤微环境（tumor microenvironment,TME）由肿瘤细胞及其周围基质和肿瘤浸润免疫细胞（tumor infiltrating immune cells,TIICs）组成[2]。研究表明高浸润丰度的肿瘤相关巨噬细胞（tumor-associated macrophages,TAM）与肿瘤的不良预后相关，大多数TAM表达为M2表型。关于机制研究，有研究表明TLR2/NOX2/自噬轴、Wnt/β-catenin信号通路等可以促进M2型巨噬细胞极化，增强肿瘤的恶性行为[3-4]。V-set包含免疫球蛋白域4（V-set and immunoglobulin domain containing 4,VSIG）是M2型巨噬细胞的免疫标记基因[5]，并且，VSIG4表达水平与卵巢癌、肝细胞癌、前列腺癌、结直肠癌等多种癌症的预后相关[6-9]，但关于VSIG4在乳腺癌中的研究目前仍较少。

本研究通过CIBERSORT（https://cibersort.stanford.edu/）计算乳腺癌样本中TIICs的浸润丰度，通过建立乳腺癌风险模型，从多方面分析M2型巨噬细胞与乳腺癌患者的预后相关性。并进一步通过基因集富集分析（gene set enrichment analysis,GSEA）分析VSIG4的表达水平与多种信号通路之间的相关性，并预测VSIG4的上游调控miRNA，探索VSIG4与乳腺癌肿瘤免疫之间的潜在机制。

1 资料与方法

1.1 患者数据获取

从TCGA下载乳腺癌患者的RNA-seq数据（经过FPKM标准化）和临床资料（包括年龄、生存时间、生存状态、T、N、M、病理分期、ER、PR、HER2状态），包括1 109例乳腺癌肿瘤标本和113例乳腺癌癌旁组织标本。……