肾嫌色细胞癌ceRNA调控网络的构建与分析

李冰滢， 刘 畅， 李 枫， 张庆梅， 罗 彬， 葛盈盈， 农蔚霞， 陈 芳， 肖绍文， 谢小薰

肾嫌色细胞癌(chromophobe renal cell carcinoma,CRCC)是一种来源于集合管上皮暗细胞的肾肿瘤，于1985年由Thoenes等[1]首次报道。CRCC多发于50～60岁，临床上无特殊病状和特征，部分患者可出现血尿或肿瘤压迫症状，仅有少数病例呈弥漫生长并侵及肾周脂肪组织和肾静脉[2-3]。有研究显示，CRCC的5年疾病无复发生存率(relapse-free survival,RFS)为89.3%，癌症特异性生存率(cancer-specific survival,CSS)为93%，并指出性别、TNM分期以及肉瘤样分化是预测CRCC预后的重要指标[4]。总而言之，CRCC是一种具有特殊形态、少见、低度恶性的肾细胞癌，相对于其他肾肿瘤而言，单纯CRCC预后较为乐观。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是指不编码蛋白质的RNA，主要分为短非编码RNA和长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)两类，其在基因的转录中起着重要的调控作用。lncRNA是长度>200 nt(核苷酸)的RNA分子，它不仅参与了机体正常的生物学功能，同时也与许多肿瘤疾病的发生、发展具有关联[5-7]。除lncRNA外，近年来微小RNA(micro RNA,miRNA)发现对肿瘤研究的发展也起到了重要作用，其是一类长约22 nt(核苷酸)的保守非编码单链小RNA，最早于1993年由Lee等[8]在秀丽虫中发现。当miRNA与信使RNA(messenger RNA,mRNA)结合时，可通过结合靶基因上的miRNA反应元件(microRNA response element,MRE)降解或沉默其靶基因从而抑制mRNA的翻译[9]，其不仅参与细胞生长、衰老和凋亡的调节，而且与生命过程的各阶段密切相关[10-11]。但目前关于lncRNA与miRNA在CRCC中的研究仍鲜见。值得注意的是，近年有研究发现lncRNA具有“Spone”的功能，即与miRNA联系并调节miRNA的靶基因，这是一个更为复杂且精细的分子调控机制，称之为“内源竞争性RNA(competing endogenous RNAs，ceRNA)调控网络”。2011年Pier等首次提出ceRNA的假说，其核心认为ceRNA可通过MRE竞争结合相同的miRNA以调节靶基因的表达水平，即lncRNA可以作为ceRNA竞争性地结合miRNA以调控mRNA[12]。目……