基于生物信息学分析miR-130b-3p在肾透明细胞癌中的表达、靶基因及预后价值①

邹元章 卢俅 陈兵海（江苏大学附属医院泌尿外科，镇江212001）

miRNA是长度约为22个碱基的一类非编码单链小分子RNA，可通过结合mRNA靶基因的3'非编码区（3'UTR）导致靶标降解或抑制该mRNA翻译［1］。miRNA通过负调节细胞过程相关基因参与细胞周期调节、应激反应以及细胞分化、增殖、侵袭、迁移和凋亡等过程［2-4］。因此，miRNA涉及细胞内信号转导通路的多个方面。近年，miRNA在人类疾病尤其肿瘤中的作用不断被揭示，研究已表明大量miRNA在肿瘤组织中异常表达，并在肿瘤发生发展过程中起重要作用［5-6］。

miR-130b-3p（曾为hsa-miR-130b）位于人染色体22q11.22区，研究显示，miR-130b-3p在乳腺癌、膀胱癌、胰腺癌等多种肿瘤中表达异常，并参与肿瘤发展，有望成为以上肿瘤治疗靶点及预后生物标志物［7-10］。此外，研究报道，miR-130b-3p在肾透明细胞癌（renal clear cell carcinoma，KIRC）组织和细胞系中表达上调，且可促进肾癌细胞迁移、增殖，抑制其凋亡，因而有望成为KIRC的诊断标志物和治疗靶点［11］。但miR-130b-3p在KIRC中的调控靶基因和预后价值尚未明确。因此，本研究通过生物信息学方法分析miR-130b-3p在KIRC中的表达水平、靶基因及预后意义，为进一步探索miR-130b-3p在KIRC中的作用机制和临床应用提供理论基础。

1 材料与方法

1.1 miR-130b-3p的注释信息查询miRBase数据库是在线开放的microRNA序列和注释资源库，其最新版本包含来自271个生物的miRNA序列，包括38 589个miRNA前体和48 860个成熟体［12］。采用miRBase数据库查询miR-130b-3p在不同生物中的序列和注释信息。

1.2 miR-130b-3p在肿瘤组织中的表达分析db-DEMC2.0数 据 库（https：//www.picb.ac.cn/db-DEMC/）整合了GEO和TCGA数据库的209个数据集，储存了在36种肿瘤中差异表达的2 224个miRNA。UCSC（https：//genome.ucsc.edu/）数据库包含TCGA和GDC的肿瘤数据，可提供数据下载和实现数据在线可视化。……