肺腺癌预后不良的重要基因CDC20、CCNB2和CDC45

龙焕屏，李光

（中国医科大学附属第一医院放射治疗科，沈阳 110001）

在癌症死亡患者中肺癌占27%，是癌症相关死亡的主要原因［1］。肺腺癌（lung adenocarcinoma，LUAD）已经成为近数十年来最常见的肺癌类型之一，并且LUAD倾向于早期转移，能够导致很高的死亡率［2］。因此，寻找可靠的预后标志物和治疗靶点对提高LUAD的治疗效果非常重要。随着生物技术的发展，可以通过微阵列检测成千上万个基因的表达水平，进一步促进了癌症的研究。本研究通过分析基因表达微阵列数据（GSE33532、GSE32863和GSE43458）探索了LUAD中差异表达基因的相互作用网络以及相关的信号传导途径，最终鉴定出3个核心基因CDC45、CCNB2和CDC20可以作为LUAD的候选生物标志，从而为LUAD的潜在生物学机制和治疗靶标提供有用的信息和方向。

1 材料与方法

1.1 微阵列数据信息

从美国国立生物技术信息中心的基因表达汇编（Gene Expression Omnibus，GEO）数据库中选 取GSE33532、GSE32863和GSE43458的芯片数据，共178例LUAD和98例正常肺组织。

1.2 差异表达基因的筛选

使用GEO2R筛选LUAD和正常肺组织之间的差异表达基因，筛选条件是|logFC|≥ 1和调整P＜ 0.001。然后，使用Venn diagram软件获得3个基因芯片的共同差异表达基因，log FC ＞ 0定义为上调基因，log FC ＜ 0定义为下调基因。

1.3 基因本体（Gene Ontology，GO）分析和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）分析

使用注释、可视化和集成发现数据库（The Database for Annotation，Visualization，and Integrated Discovery，DAVID）对基因进行分子功能（molecular function，MF）、细胞成分（cellular component，CC）、生物过程（biological process，BP）和KEGG分析（P＜ 0.05）。

1.4 蛋白-蛋白相互作用网络（protein-protein interaction network，PPI）的建立和重要模块的分析

通过STRING获取PPI信息。然后，使用Cytoscape检查基因之间潜在的相关性，使用MCODE获得重要模块。

1.5 核心基因的生存分析

通过Kaplan-Meier Plotter在线数据库评估基因对预后的影响（P＜ 0.05）。……