特发性肺动脉高压患者外周血单核细胞差异表达基因分析

郭海森,张炜岱,倪楚民,周琳洁,蔡志雄,朱稚丹

汕头市中心医院 中山大学附属汕头医院 心血管内科，广东 汕头 515031

特发性肺动脉高压(IPAH)是由于不明原因引起肺小动脉收缩、增生和重塑导致肺血管阻力增加，平均肺动脉压在静息状态下≥25mmHg，且排除其他病因所致的肺高压[1]。目前IPAH的基因表达特点仍未研究透彻。此外，系统性硬化病所致肺动脉高压(SSc-PAH)在临床上较为常见，但由于病因不同，IPAH和SSc-PAH在治疗和预后等方面存在明显差异，探究两者的基因表达差异，有助于鉴别诊断和个体化治疗[2]。因此，本研究借助基因芯片数据，分别探究IPAH与健康人群、系统性硬化病相关肺动脉高压的基因表达差异，为进一步临床研究提供方向和思路。

1 资料与方法

1.1 资料来源与分组

美国国立生物技术信息中心的GEO数据库(www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)收录了大量基因芯片检测信息。本研究基于该数据库中收录的GSE33463数据集进行分析，该数据集为病例对照研究设计，包含140例病例(其中特发性肺动脉高压病例30例，系统性硬化病相关肺动脉高压42例，系统性硬化病相关肺高压伴间质性肺病8例，系统性硬化病不伴有肺动脉高压19例)和41例健康对照，病例基线信息详见原始研究[3]。该数据集分析外周血标本，Ficoll密度梯度法分离外周血单核细胞，提取和纯化RNA，应用Illumina HumanHT-12 V3.0 expression beadchip芯片平台进行基因表达谱分析[3]。根据DNA转录为RNA过程中的转录水平高低，筛选转录水平上调基因和转录水平下调基因，以供进一步分析。

在原始研究的基础上，本研究进一步将特发性肺动脉高压(IPAH)组与系统性硬化病相关肺动脉高压(SSc-PAH)组进行比较分析，探究其基因和信号通路的差异(原始研究和本研究的分组方式，见图1 )。……