基于全基因组重测序对不同鸭遗传资源进行群体结构分析

王统苗，郭其新，白 皓,3，常国斌，陈国宏*

（1.扬州大学动物科学与技术学院，江苏扬州 225009；2.靖江市农业农村局，江苏泰州 214500；3.扬州大学农业科技发展研究院，教育部农业与农产品安全国际合作联合实验室，江苏扬州 225009）

我国鸭产业发展历史悠久，鸭遗传资源丰富。然而，随着社会经济的快速发展、人口居住地的迁移和生态环境的变化，鸭种质资源的丢失也在加快[1]。研究鸭遗传资源群体结构，可以为鸭遗传资源保种工作提供科学有效的数据。高通量测序技术的出现及迅速发展可以更快速、有效取得大量的生物遗传变异信息[2]。

基于全基因组重测序的群体遗传进化分析是通过测序手段和生物信息分析技术相结合来探讨生物群体的遗传结构，为育种、进化等研究工作提供了理论基础。陈彬龙[3]利用全基因组重测序技术对不同地理位置的藏鸡的群体结构进行了分析，系统发育进化树和主成分分析（PCA）结果显示，6 个具有地理代表性的藏鸡群体至少存在3 个明显的分支，这些独特的分布模式显示藏鸡可能与其他家鸡一样是多起源的；章双杰等[4]利用全基因组测序技术对娄门鸭、昆山麻鸭、巢湖鸭和高邮鸭进行遗传多样性分析，通过群体系统进化树分析和CNV 交集分析发现娄门鸭和昆山麻鸭为一类，巢湖鸭和高邮鸭为一类；Haile[5]利用全基因组重测序对埃塞俄比亚和中国山羊群体的群体结构进行分析，通过系统发育分析将山羊品种按照其起源地分成了4 个分支。……