TGFβ1T29C多态性与NSCLC易感性及放射敏感性的相关性研究

2014-12-23 00:55黄友为周光华
关键词:等位基因多态性基因型

黄友为,周光华

(湖南师范大学第二附属医院,解放军第163 医院,湖南 长沙 410003)

转化生长因子β1 (TGFβ1)是人体内一种维持内平衡的重要多效细胞因子,其主要作用是调节炎症、免疫反应、细胞生长及分化,诱导上皮间质化(EMT)发生和肿瘤血管生成,调控细胞增殖和凋亡等。TGFβ1 广泛表达于正常组织及肿瘤组织,在早期肿瘤组织中起抑制癌细胞生长、迁移,表现为抑癌作用;而在晚期肿瘤中促进肿瘤组织生长,与肿瘤发展、预后相关[1]。当TGFβ1 编码区第29 位核苷酸由T 突变为C,引起密码子10 编码的氨基酸从Leu变成Pro,不仅影响了该细胞因子的血浆含量,还导致其功能的改变[2,3]。许多研究表明,TGFβ1 T29C多态性与肿瘤疾病密切相关,尤其集中在乳腺癌、胃癌,但也有不少研究认为它们之间无明显相关性,随着越来越多的最新研究加入,TGFβ1 T29C 多态性与肿瘤相关性得到肯定。TGFβ1 T29C 多态性与非小细胞肺癌(NSCLC)之间的相关性研究目前国内外报道不多,本研究通过比较对照组与NSCLC 组TGFβ1 T29C 等位基因分布情况,探讨TGFβ1 T29C单核苷酸多态性(SNP)与NSCLC 易感性是否存在相关性,同时进一步研究该位点与NSCLC 的放射敏感性是否存在相关性。

1 材料与方法

1.1 研究对象的选择

收集60 例(31 例男性,29 例女性,平均年龄为65.6 岁)2013年5月~2013年10月在湖南师范大学第二附属医院肿瘤中心病理确诊为ⅢB 期NSCLC患者的血样(5mL),所有患者放疗前未行其它治疗。同时收集62 例(32 例男性,30 例女性,平均年龄为62.5 岁)2013年9月在湖南师范大学第二附属医院进行体检的健康人的血样(5mL)作为对照组,对照组排除患有心血管疾病、肾脏疾病、风湿病、糖尿病等其他可能导致假阳性结果的人群。肺癌组与对照组成员均为湖南省长沙地区汉族人。

1.2 实验方法与判断标准

DNA 提取:采用OMEGA(D3471-02)全血基因组提取试剂盒按照说明书步骤提取外周静脉血白细胞DNA。

引物的合成:引物合成及PCR 产物测序由武汉华大基因公司完成。TGF-β1 T29C 上游引物为:5'-CCC TAT TCA AGA CCA CCC A-3',下游引物为:5'-GCC AGT CAC TTC CTA CCC G-3'。

目的基因扩增:PCR 反应体系为50 μL,包括ddH2O 37.5 μL,10mM dNTP 1μL,10 ×PCR buffer 5 μL,25mM Mgcl2 3 μL,上、下游引物各1 μL,DNA模板1 μL。PCR 扩增条件:94℃变性1min,58℃退火50sec,72℃延伸1min30sec,进行40 个循环,然后72℃延伸10min 后4℃保温。最后PCR 产物用1%的琼脂糖凝胶电泳检测。

PCR 产物测序步骤:①测序DNA 模板的纯度与用量:DNA 纯度:OD260/OD280 =1.6 ~2.0。使用酒精/NaAc 法在测序前对PCR 产物进行纯化,然后再进行DNA 测序的PCR 反应。②质粒和PCR 产物测序:反应体系为20μL,包括引物1μL,DNA 模板1μL,BigDye 8μL,灭菌去离子水10μL。测序PCR热循环条件:96℃1 min→(96 ℃10 sec→50 ℃5 sec→60 ℃4 min)×25 个循环→4 ℃保温。③测序产物纯化:20 μL 反应体系,酒精/EDTA/NaAc 法纯化后使用ABI3730xl 测序仪测序。

观察指标:TGFβ1T29C 基因TT、TC、CC 基因型及T、C 等位基因频率分布情况。并统计TGFβ1 29位点多态性在肺癌组与对照组的分布,分析肺癌组TGFβ1 29 位点多态性与放射敏感性的关系 依据放疗前后患者胸部CT 检查测量放疗前后肿瘤大小,计算肿瘤缩小百分比。疗效评价标准按照WHO 制定的标准分为有效和无效两组,有效组包括完全缓解(CR)和部分缓解(PR),无效组包括稳定(SD)和进展(PD)。

1.3 统计学处理

应用双侧卡方检验比较NSCLC 组与对照组的TGFβ1 基因29 位点频率分布差异,用以评估TGFβ1 SNP 与NSCLC 易感性的相关性。统计NSCLC 患者放疗前后肿瘤缩小百分比,应用双侧卡方检验比较NSCLC 患者TGFβ1 基因29 位点频率分布与疗效的相关性,用以评估TGFβ1 SNP 与NSCLC 放射敏感性的相关性。所有统计分析采用SHEsis 和SPSS 13.0 统计软件处理。

2 结果

2.1 Hardy-weinberg 平衡检验结果

结果发现肺癌组和对照组χ2值分别为0.258和0.003(P >0.05),符合Hardy-weinberg 平衡,具有群体代表性。

2.2 TGFβ1 T29C PCR 扩增产物电泳图及各表型测序图

图1 扩增胶图,1%琼脂糖凝胶电泳,3μL 上样量,MARKER 为DL2000 PLUS

图2 TGFβ1 T29C 各表型测序图(分别为CC、TC、TT 型)

2.3 TGFβ1 基因29 位点多态性在NSCLC 组和对照组的分布

由表1 可见,NSCLC 组和对照组的T 与C 等位基因频率分别为51.7%、58.1%和48.3%、41.9%。NSCLC 组的T 等位基因频率略低于对照组,C 等位基因频率略高于对照组,但经统计学分析两组无显著性差异(χ2=1.008 P >0.05)。

表1 TGFβ1 基因29 位点等位基因在非小细胞肺癌组和对照组的分布频率

两组的TGFβ1 基因型分布见表2。NSCLC 组的TT、TC、CC 基因型频率分别为28.3%、46.7%及25.0%。对照组的TT、TC、CC 基因型频率分别为33.9%、48.4%及17.7%。NSCLC 组中CC 纯合子基因型的频率要高于正常组,TT 基因型要低于健康对照组,但两组之间的差异尚不显著(P >0.05)。CC 基因型相对于TT 基因型患肺癌的OR(相对风险度)为0.59(95% CI:0.22 ~1.63),TC 基因型相对于TT 基因型患肺癌的OR 为0.87(95% CI:0.38~1.97),C 等位基因OR 为1.30(95% CI:0.78 ~2.15)。

表2 TGFβ1 基因29 位点基因型分布情况

2.4 NSCLC 组TGFβ1 基因29 位点多态性与放射敏感性的关系

从表3 可以看出,不同TGFβ1 基因29 位点基因型的NSCLC 患者对放疗的有效率不尽相同,TC基因型的患者对放疗的有效率低,仅为28.6%,其次为CC 基因型,为50.0%,而TT 基因型的患者对放疗的有效率较高,为64.7%,三者之间的差异有统计学意义(χ2=6.125 P <0.05)。

表3 不同基因型非小细胞肺癌患者放疗的疗效比较

3 讨论

TGFβ1 自1972年发现以来,其相关研究取得了很大进展。TGFβ1 基因定位于19q13.1,cDNA 全长2745 bp,含7 个外显子和6 个内含子[4]。TGFβ 主要通过TGFβ/SMAD 信号通路发挥作用,TGFβ(TGFβ1、TGFβ2、TGFβ3)在多数细胞类型中与膜受体TGFβR1(ALK5)、TGFβR2 结合,活化的TGFβ 受体使其位于羧基端的丝氨酸磷酸化,SMAD 蛋白(SMAD2、SMAD3、SMAD4)就形成二聚体,直接转运至细胞核,行使转录因子的功能,最终表现出细胞生长抑制及凋亡;在内皮细胞中,TGFβ 与ALK1 膜受体结合,激活胞内SMAD1、SMAD5 作用于细胞核,从而影响细胞增殖、迁移[5]。此外,TGFβ 还存在非SMAD 信号通路,包括Erk,JNK/p38 ,RhoA,PI3K/AKT 等[6]。TGFβ1 SNP 与肿瘤易感性的相关性研究结果一直处于矛盾状态。不少研究显示,TGFβ1 29 位点为C/C 型的TGFβ1 分泌量明显高于T/T型[3,7],TGFβ1 T29C/C 型患肿瘤的风险显著升高[5,8,9]。然而也有学者得到相反的结果[3,10],这种矛盾的现象可能是TGFβ 双重作用所致,即TGFβ 减少早期肿瘤的发生风险,促进肿瘤的进展[3]。不同区域、人群之间TGFβ1 T29C 基因型分布各不相同[7,11],本实验结果显示,湖南地区汉族人TGFβ1 T29C 基因型分布情况与其他省份地区相差不大[12];湖南地区汉族人TGFβ1 T29C 的多态性与NSCLC 的易感性之间无显著相关性,与Lu Bai 等人[13]研究辽宁省汉族人群TGFβ1 T29C 的多态性与NSCLC 易感性的结果相同。

TGFβ1 T29C 多态性与肺癌进展及预后存在相关性,Xianglin Yuan 等人回顾性研究发现TGFβ1 T29C CT/CC 基因型NCSLC 患者有更差的远处转移率及头部转移率,同时他们通过慢病毒转染A549和PC9 细胞体外实验发现C 等位基因型对比T 型有更强的活力及侵袭性,TGFβ1 29C 基因型细胞具有很强的转移及侵袭潜能[14]。 Mukaddes ColakogμLlari 等人[15]进行土耳其人群肺癌患者与健康人对照临床研究发现,TGFβ1 的T29C 多态性与肺癌患者的生存时间密切相关,T/T 基因型患者较C/C 基因型患者生存时间长。C 基因携带者具有更强的进展风险及更差的预后,可能导致C 基因携带者对放疗疗效不佳。本研究结果表明,TGFβ1 29 位点单核苷酸多态性与NSCLC 患者的放射敏感性具有相关性,其中TT 患者对放疗敏感,而CT 和CC 患者对放疗敏感性较差。但限于本实验病例数较少,仍需进一步大样本临床研究验证,以期通过检测放疗患者的TGFβ1 T29C 不同基因型的方法来选择不同剂量强度,以达到个体化治疗的目的。

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