海南4个野生地理群体长肋日月贝AFLP分析

2016-12-21 07:50:02朱彩艳江世贵杨其彬张殿昌苏天凤
海南热带海洋学院学报 2016年2期
关键词:分析

朱彩艳,江世贵,杨其彬,2,张殿昌,苏天凤,王 雨,2

(1中国水产科学研究院南海水产研究所,广州 510300;2中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心,海南 三亚 572018)



海南4个野生地理群体长肋日月贝AFLP分析

朱彩艳1,江世贵1,杨其彬1,2,张殿昌1,苏天凤1,王 雨1,2

(1中国水产科学研究院南海水产研究所,广州 510300;2中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心,海南 三亚 572018)

为了解长肋日月贝(Amusiumpleuronectes)种群遗传结构,本研究应用6对引物,采用AFLP分子标记技术对中国海南4个野生群体(共134个个体)的长肋日月贝进行遗传结构分析.结果显示,6对引物组合共扩增出203条扩增带,平均每对引物组合产生33.8条扩增带;扩增带中的多态性位点共97条,多态位点所占比例为47.78%.统计分析了4个野生群体的多态性位点、群体Nei氏遗传多样性指数和Shannon’s 信息指数等,并进行了UPGMA聚类分析.结果表明,4个群体的群体Nei氏遗传多样性指数在0.0957~0.1 135之间,Shannon’s 信息指数均在0.1 493~0.1 769之间,4个群体的遗传多样性均偏低.陵水群体(LS)和三亚群体(SY)的多态性位点的比率均为40.89%,潭门群体(TM)的多态性位点比率最低,为34.4 8%;4个不同群体间遗传距离都不大,SY与白马井群体(BMJ)间遗传距离最大,为0.0162,TM与BMJ间的遗传距离最小,为0.0049;没有发现群体特异性条带.分析了各群体内部的个体间遗传距离,结果表明,BMJ、TM、LS和SY群体内部的遗传距离分别为0.1 217、0.1 065、0.1 212和0.1 179.AMOVA分析结果显示,种群间的分化系数(Fst)为0.06834,基因流水平(Nm)为3.4 08.表明野生长肋日月贝的遗传变异主要来自群体内部,群体间……

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