CBX1在胃癌中的表达及与胃癌患者病理特征相关性的生物信息学分析*

吴 爽，张涛元，李 俏，曹三成，祝撷英△

1.西安交通大学附属西安市儿童医院检验科，陕西西安 710003；2.日照心脏病医院麻醉科，山东日照 276800

胃癌的恶性程度和病死率均较高，由于胃癌在早期缺乏特异性症状，导致其早期诊断率较低[1]。目前已发现许多基因参与了胃癌的发生、发展，但胃癌的发病机制仍未完全被揭示[2]。人类基因组中CBX家族共包含8个基因，均与异染色质、基因表达及生长发育等生物过程密切相关。生物信息学技术分析结果表明CBX1在肝细胞癌、乳腺癌等多种癌症中发挥重要作用[3]，然而其在胃癌中的作用机制仍不明确。

微阵列技术和生物信息学技术已被广泛用于鉴定基因组的表达水平，帮助识别与癌症相关的差异表达基因和相关信号通路[4]。本研究利用生物信息学技术，分析胃癌中CBX1的表达情况，探究CBX1与胃癌患者病理参数和预后的关联，聚焦其在胃癌中可能参与的生物学过程，提供胃癌早期诊断和预后相关的标志物。

1 材料与方法

1.1CBX1在转录水平表达差异的验证 利用Oncomine数据库[5]，比较CBX1在胃癌组织与正常胃组织中转录水平的表达差异，同时获取胃癌组织与正常胃组织中CBX1的研究数据，参数设置如下：t检验，P=0.01，变化倍数为1.5倍，基因等级为10%，类型为mRNA。利用GEPIA数据库中肿瘤基因组图谱与基因表达项目(GTEx)的数据，分析验证CBX1在正常胃组织与胃癌组织中的转录水平的表达差异，参数设置如下：方差分析，|Log2(FC)|最佳临界值为1.0，q=0.01。

1.2蛋白质印迹法(Western blot)验证CBX1在正常胃黏膜细胞GSE-1和胃癌细胞SGC7901中的表达差异 兔抗人CBX1(PA5-28448)抗体购自美国Invitrogen Ebioscience公司，GAPDH抗体购自英国Abcom公司。……