腺性膀胱炎差异表达基因生物信息学分析及关键基因筛选

2021-05-07 10:13:12胡超段灵星梁挺陈光鲁雄兵
山东医药 2021年12期
关键词:差异信号分析

胡超,段灵星,梁挺,陈光,鲁雄兵

1南昌大学,南昌330000;2南昌大学第二附属医院

腺性膀胱炎(CG)是膀胱黏膜的一种增生化生性病变,发病率为0.1%~1.9%[1-2]。近年来随着泌尿外科腔镜技术的发展和普及,CG患病率有增加的趋势[3]。CG缺乏特征性的临床表现,一般表现为膀胱刺激症状、镜下甚至肉眼血尿,若病变侵犯输尿管开口,可能出现腰部酸胀等不适[4]。CG的发病机制仍不甚清楚,有研究认为是移行上皮在慢性刺激因素作用下化生为囊腔,腔内柱状上皮形成进而导致病变的发生[5]。既往有学者针对部分相关基因进行研究,挖掘其在CG中的作用及潜在机制,为CG潜在的生物标志物和治疗靶标提供了一定思路[6]。我们综合以往的报道发现,现有研究不足以全面的阐明CG的形成,有关CG的发生发展机制需要进一步探索。受到高通量测序技术(HTS)与DNA芯片技术水平大幅提升的影响,基于转录组、基因组、蛋白质组和代谢组等不同层次对疾病进行研究已成为全世界学者的共识。本研究通过对美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共数据平台中的表达谱芯片原始数据进行挖掘,获取CG的差异表达基因,在此基础上进行生物信息学分析,并筛选出CG关键基因,旨在为深入揭示CG的分子机制和治疗靶点提供研究方向和理论依据。

1 资料与方法

1.1 芯片数据来源介绍 从NCBI公共数据平台基因表达数据库(GEO,http:/www.ncbinlm.nih.gov/geo)下载CG相关基因芯片数 据 集GSE11783(https://www.ncbinlm.nihgov/geo/query/acc.cgiacc=GSE11783)。该数据集基于GPL570平台采用[HG-U133 Plus 2]Human Genome U133 Plus 2.0 Ar⁃ray阵列芯片(美国Affymetrix公司)检测的16例人膀胱组织……

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