Ⅰ期结直肠癌转移基因突变特征及临床特征分析

李 娟 白 瑞 潘月龙

结直肠癌是一种常见的恶性肿瘤，在所有恶性肿瘤中发病数居第三位[1-2]。随着结直肠癌筛查的发展，T1/T2 结直肠癌的发现比例提高，但确诊为结直肠癌的患者大约50%～60%发生转移[3]，肝脏为最常见的转移器官[4-6]。Yaeger 等[7]在2018 年通过测序平台MSK-IMPACT 341、IMPACT 410、IMPACT 468 对1134 个结直肠癌（CRC）样本（1099 患者）进行了前瞻性靶向测序，确定APC 内含子区域的剪接改变、96%的结直肠癌增加了致癌性WNT 途径改变等。纪念斯隆凯特琳癌症研究中心（MSK）的癌症基因检测分析平台（MSK-IMPACTTM）是一种基于二代测序（NGS panel）的杂交捕获技术，可快速检测与癌症相关的468 个独特基因上的所有蛋白质编码突变、拷贝数变异、启动子突变以及结构重排，不同于常规检测，MSK-IMPACTTM 适用于任何肿瘤类型。本研究借MSKCC 数据发掘Ⅰ期结直肠癌转移的基因突变特征及临床特征，发现较小的肿瘤可能存在较大的转移潜能，影响预后。

1 研究方法

使用cBioPortal 数据库，该数据库是由纪念斯隆凯特琳癌症研究中心（MSK）开发的一款集数据挖掘、数据整合及可视化等多功能于一体的综合性开放网络平台，是经过专业杂志Cancer Discovery 认可的数据分析工具，通过其可视化功能查看结直肠癌及Ⅰ期结直肠癌转移组相应的基因突变内容。

从cBioPortal 数据库下载结直肠癌及Ⅰ期结直肠癌转移组相关的基因突变数据。

使用R 语言3.6.1 中maftools 工具对下载数据进行再分析。

2 结果

2.1 整体CRC-2017-MSK 数据观 从整体数据来看，结肠腺瘤样息肉（Adenomatous Polyposis Coli，APC）基因突变最为明显，为76%，其次是TP53、KRAS，分别为73%、44%，BRAF 突变在这个整体数据中的比例约是11%。既往研究发现，不同的BRAF突变可能与生存率有着明显的关联，其中BRAF V600E 突变与预后较差有关[8]。……