曾裕文,吴帆,,谭国钳,张芳雍
1 暨南大学附属广州红十字会医院肝胆外科,广州510220;2 广州市红十字会医院肝胆外科
肝癌是我国高发的、危害极大的恶性肿瘤,其近年来的发病率持续上升[1]。肝癌的高异质性和放化疗耐药,以及早期诊断困难、疾病进展迅速和缺乏高效的靶向药物,导致其整体治疗效果并不理想。因此,开发肝癌早期诊断、治疗和预后的评估方法对提高肝癌患者的生存率具有重要意义。研究表明,脂质代谢失调是癌症中最显著的代谢改变之一,不仅影响原发性肿瘤的生长,而且介导肿瘤的进展和转移[2]。JIANG 等[3]通过组织微阵列芯片分析显示,胆固醇酯在254 例肝癌组织中的表达量明显高于癌旁组织,提示脂质代谢可能参与了肝癌的发生发展过程。但迄今为止,脂质代谢在肝癌中的作用尚不明确。2021年1 月—5 月,本研究通过生物信息学分析,筛选在肝癌中可能发挥重要作用的脂代谢基因,构建肝癌患者预后预测模型,并通过该模型分析脂代谢相关基因的表达与肝癌预后的相关性,以期探索脂代谢基因在肝癌诊治中的潜在价值。
1.1 mRNA 表达数据和患者临床资料收集 从癌症基因组图谱数据库(TCGA,https://portal.gdc.cancer.gov)和国际癌症基因组联合体数据库(IC⁃GC,https://daco.icgc.org/)下载截至2020年11 月收录的肝癌患者肿瘤组织和正常肝组织的mRNA转录组数据和临床资料(TCGA 库数据以欧美人种为主、ICGC数据仅为亚洲人种)。TCGA数据库共收集到374 个肝癌组织、50 个正常肝组织的mRNA 表达数据,370 例肝癌患者的临床资料,内容包括性别、年龄、生存时间、生存状态、组织学分级和TNM 分期。……